基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_018061
当前版本: OH-1004
染色体: Chr04
坐标: 5767199-5767684
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA486 bp · LXL04_018061|LXL04_018061|OH1004|cDNA
ATGACTGTTCAAGCAACTTCTCTCATGGCTCCATCGTCTCCGGTGACCATACAACGATCACCATGGCACTCACCGGTACCCTACCTGTTTGGAGGTTTAGCTGCCATGATGGGTCTCATTGCCTTCGCTCTCTTGATCCTCGCTTGCTCATACTGGAAAATCTCATCCGACGCCGGAGAAAGAGACCTTGAGGCCGGAGACGCTGACGCAGACGGCGATGGCGACTCCAAACCTGGTAATCAGAAAGAGCCCCCTGTTTT...
CDS
下载 CDS FASTA486 bp · LXL04_018061|LXL04_018061|OH1004|CDS
ATGACTGTTCAAGCAACTTCTCTCATGGCTCCATCGTCTCCGGTGACCATACAACGATCACCATGGCACTCACCGGTACCCTACCTGTTTGGAGGTTTAGCTGCCATGATGGGTCTCATTGCCTTCGCTCTCTTGATCCTCGCTTGCTCATACTGGAAAATCTCATCCGACGCCGGAGAAAGAGACCTTGAGGCCGGAGACGCTGACGCAGACGGCGATGGCGACTCCAAACCTGGTAATCAGAAAGAGCCCCCTGTTTT...
161 aa · LXL04_018061|LXL04_018061|OH1004|PROTEIN
MTVQATSLMAPSSPVTIQRSPWHSPVPYLFGGLAAMMGLIAFALLILACSYWKISSDAGERDLEAGDADADGDGDSKPGNQKEPPVFEEKYLVIMAGQAKPTFLATPISSRASSFGSCSCRSNSTVSTETSSVTEEDKQKSSDELQVMIIENHETADHELP
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_018061 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_018061 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr04:5767199-5767684 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to GDU2: Protein GLUTAMINE DUMPER 2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006521 regulation of amino acid metabolic process 生物过程 GO:0006865 amino acid transport 生物过程 GO:0009615 response to virus 生物过程 GO:0010585 glutamine secretion 生物过程 GO:0032940 secretion by cell 生物过程 GO:0044788 host-mediated perturbation of viral process 生物过程 GO:0080143 regulation of amino acid export 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G24762 ath:AT4G25760 ath:AT4G31730 ath:AT5G24920 ath:AT5G57685 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.757
细胞核0.140
内质网0.122
细胞质0.117
溶酶体／液泡0.040
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF27655.2GDU_TM26-77 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_018061 | PF27655.2 | GDU_TM | 26 | 77 | 2.7e-23 | 82.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SW07 | 拟南芥 | Protein GLUTAMINE DUMPER 2 | 59.633% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9FHH5 | 拟南芥 | Protein GLUTAMINE DUMPER 3 | 55.046% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
O81775 | 拟南芥 | Protein GLUTAMINE DUMPER 1 | 53.448% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8S8A0 | 拟南芥 | Protein GLUTAMINE DUMPER 4 | 54.808% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q3E965 | 拟南芥 | Protein GLUTAMINE DUMPER 5 | 54.839% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |