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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_018044
当前版本: OH-1004 染色体: Chr04 坐标: 5515500-5524979 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1350 bp · LXL04_018044|LXL04_018044|OH1004|cDNA

ATGGGAAGAGCACCATGCTGTGACAAAACAAACGTCAAAAAGGGACCTTGGTCTTCTGAAGAAGATGCTAAGCTCAAAGAATACATCGAAAAGTATGGAACTGGTGGTAACTGGATCGCTCTTCCCCAAAAGATCGGGCTAAAGCGGTGCGGAAAAAGTTGCAGACTGCGATGGTTGAATTACCTACGACCCAACATCAAGCACGGAGGATTTTCTGAAGAAGAAGACAACATCATCTGCAGTCTCTATATTAGTATAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1350 bp · LXL04_018044|LXL04_018044|OH1004|CDS

ATGGGAAGAGCACCATGCTGTGACAAAACAAACGTCAAAAAGGGACCTTGGTCTTCTGAAGAAGATGCTAAGCTCAAAGAATACATCGAAAAGTATGGAACTGGTGGTAACTGGATCGCTCTTCCCCAAAAGATCGGGCTAAAGCGGTGCGGAAAAAGTTGCAGACTGCGATGGTTGAATTACCTACGACCCAACATCAAGCACGGAGGATTTTCTGAAGAAGAAGACAACATCATCTGCAGTCTCTATATTAGTATAGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

449 aa · LXL04_018044|LXL04_018044|OH1004|PROTEIN

MGRAPCCDKTNVKKGPWSSEEDAKLKEYIEKYGTGGNWIALPQKIGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGGFSEEEDNIICSLYISIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTRLKKKLLGRRKQSQANRLSGNSSQDQKESNGIETLSNSAIERLQLHMQLQSLENPNFSQYDHNNPPMWPCKLNPIQEKMMQTLQLVNESSNPLMLQNFSPATPQKVEYYEQSNNPVLQQEYNSSMSSMMINGMENPMGNININPDSSSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_018044
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_018044
位置Chr04:5515500-5524979 (+)
描述Similar to MYB36: Transcription factor MYB36
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57620 转录因子，激活内胚层分化所需的基因，但抑制参与增殖分裂的基因，从而调节根内皮层从增殖到分化的转变。
MYB36 regulates the transition from proliferation to differentiation in the Arabidopsis root.2015 · DOI: 10.1073/pnas.1515576112
At3g49690 转录激活因子（通过相似性）。
Blind homologous R2R3 Myb genes control the pattern of lateral meristem initiation in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.038745
At4g37780 转录因子，参与调控影响细胞壁组织和重塑的基因。
Chimeric repressor analysis identifies MYB87 as a possible regulator of morphogenesis via cell wall organization and remodeling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1007/s10529-013-1451-8
At2g36890 转录激活因子（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At5g23000 参与调控分生组织能力相关基因（如CUC2）的转录激活因子。
Blind homologous R2R3 Myb genes control the pattern of lateral meristem initiation in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.038745
Arabidopsis REGULATOR OF AXILLARY MERISTEMS1 controls a leaf axil stem cell niche and modulates vegetative development.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.038588

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018044 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008285 negative regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程
GO:0009785 blue light signaling pathway 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0045597 positive regulation of cell differentiation 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0050801 monoatomic ion homeostasis 生物过程
GO:0090506 axillary shoot meristem initiation 生物过程
GO:2000067 regulation of root morphogenesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G36890
ath:AT3G49690
ath:AT4G37780
ath:AT5G23000
ath:AT5G57620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.914
排名 1 · LXL04_018044 · OH-1004
细胞质0.168
排名 2 · LXL04_018044 · OH-1004
细胞膜0.023
排名 3 · LXL04_018044 · OH-1004
线粒体0.020
排名 4 · LXL04_018044 · OH-1004
内质网0.010
排名 5 · LXL04_018044 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249.38Myb_DNA-binding14-62 aa
PF13921.13Myb_DNA-bind_617-76 aa
PF00249.38Myb_DNA-binding69-112 aa
PF13921.13Myb_DNA-bind_671-116 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_018044PF00249.38Myb_DNA-binding14622.4e-31108.3
LXL04_018044PF13921.13Myb_DNA-bind_617765.1e-1968.9
LXL04_018044PF00249.38Myb_DNA-binding691122.4e-31108.3
LXL04_018044PF13921.13Myb_DNA-bind_6711165.1e-1968.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FKL2拟南芥Transcription factor MYB3653.636%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9M2Y9拟南芥Transcription factor RAX388.618%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
F4JSU0拟南芥Transcription factor MYB8779.845%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SJL7拟南芥Transcription factor RAX283.193%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FG68拟南芥Transcription factor RAX182.203%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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