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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_017355
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 147156850-147161438 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1923 bp · LXL04_017355|LXL04_017355|OH1004|cDNA

ATGTCTTTGGTTACCGACAATGGCAGTGAACCTGAACCTTTCGCCTCtacctccacctccaccgccacctCTGTCCAATGGTTACAAACATGCCGTCACTTCGAATTTCATGAAATTCTCTTAGCAACAGAAAACTTTGATGAATCCTTAGTAATTGGGCGTGGGGGTTTTGGGAAAGTTTACAGAGGTAACGTTTTCAATGGATCAAGTGAAGTCGTTGCTGCCATTAAACGTTTGGATTCCATGTCTAATCAAGGCGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1638 bp · LXL04_017355|LXL04_017355|OH1004|CDS

ATGTCTTTGGTTACCGACAATGGCAGTGAACCTGAACCTTTCGCCTCTACCTCCACCTCCACCGCCACCTCTGTCCAATGGTTACAAACATGCCGTCACTTCGAATTTCATGAAATTCTCTTAGCAACAGAAAACTTTGATGAATCCTTAGTAATTGGGCGTGGGGGTTTTGGGAAAGTTTACAGAGGTAACGTTTTCAATGGATCAAGTGAAGTCGTTGCTGCCATTAAACGTTTGGATTCCATGTCTAATCAAGGCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

545 aa · LXL04_017355|LXL04_017355|OH1004|PROTEIN

MSLVTDNGSEPEPFASTSTSTATSVQWLQTCRHFEFHEILLATENFDESLVIGRGGFGKVYRGNVFNGSSEVVAAIKRLDSMSNQGAIEFWAEVDMLSKLRHCHLVSLIGYCNHGKEMILVYDYMPRGTLEDHLHKLSTPLSWIQRLKICIGAGRGLDYLHTGTGIESGVIHRDVKSSNILLHENMAAKISDFGLSKIGPINQPSTYVNTLVKGTFGYLDPNYFRTGRLTRKSDVYSFGVVLLEVLCRRRAVDKTLDEEQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_017355
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_017355
位置Chr03:147156850-147161438 (+)
描述Similar to FER: Receptor-like protein kinase FERONIA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017355 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0030308 negative regulation of cell growth 生物过程
GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G51550
ath:AT5G38990
ath:AT5G39000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.506
排名 1 · LXL04_017355 · OH-1004
细胞质0.388
排名 2 · LXL04_017355 · OH-1004
细胞核0.246
排名 3 · LXL04_017355 · OH-1004
内质网0.043
排名 4 · LXL04_017355 · OH-1004
高尔基体0.038
排名 5 · LXL04_017355 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr51-318 aa
PF00069.32Pkinase51-318 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr356-545 aa
PF00069.32Pkinase356-545 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_017355PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr513184.8e-78262.7
LXL04_017355PF00069.32Pkinase513181.1e-66225.6
LXL04_017355PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3565454.8e-78262.7
LXL04_017355PF00069.32Pkinase3565451.1e-66225.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SCZ4拟南芥Receptor-like protein kinase FERONIA55.937%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FID8拟南芥Putative receptor-like protein kinase At5g3900049.852%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FID9拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g3899050.755%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LK35拟南芥Receptor-like protein kinase THESEUS 150.289%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q3E8W4拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR254.426%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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