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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_017063
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 140360680-140363556 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2190 bp · LXL04_017063|LXL04_017063|OH1004|cDNA

ATGTCGGCAGCCACCGGAGATCAACCCTCCACCTCCTCTTCCACATATGGTTCACAACCATGTCGCCGGTTTGAATTTACCGAGATTCTCTCAGCGACCGACAACTTTAACGAATCATTAGTAGTTGGGCGTGGAGGATTTGGAAAAGTTTACAAAGGTGAAATTCTCAATGGATCAACTCTTGTTCTTGCCGCCATCAAGCGGTTGGATTCCATGTCCAATCAAGGGGAAGAAGAGTTTCGGGCGGAAGTTGAGATGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2190 bp · LXL04_017063|LXL04_017063|OH1004|CDS

ATGTCGGCAGCCACCGGAGATCAACCCTCCACCTCCTCTTCCACATATGGTTCACAACCATGTCGCCGGTTTGAATTTACCGAGATTCTCTCAGCGACCGACAACTTTAACGAATCATTAGTAGTTGGGCGTGGAGGATTTGGAAAAGTTTACAAAGGTGAAATTCTCAATGGATCAACTCTTGTTCTTGCCGCCATCAAGCGGTTGGATTCCATGTCCAATCAAGGGGAAGAAGAGTTTCGGGCGGAAGTTGAGATGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

729 aa · LXL04_017063|LXL04_017063|OH1004|PROTEIN

MSAATGDQPSTSSSTYGSQPCRRFEFTEILSATDNFNESLVVGRGGFGKVYKGEILNGSTLVLAAIKRLDSMSNQGEEEFRAEVEMLSKLRHSHLVSLFGYCNYESEKILVSLFGYCNYETEKILIYEYMPNGTLEDHLHKLGTHLSWLQRLKICIGAARGLDYLHTGTGIETGVIHRDVKTSNILLHESWAAKISDFGLSRVAPTNQQSTYVNTLVKGTFGYFDPNYFATGRLTRKSDVYAFGVVLFEVLCRKRAVDKS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_017063
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_017063
位置Chr03:140360680-140363556 (+)
描述Similar to BAK1: BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33430 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
The BRI1-associated kinase 1, BAK1, has a brassinolide-independent role in plant cell-death control.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.046
BAK1 and BKK1 regulate brassinosteroid-dependent growth and brassinosteroid-independent cell-death pathways.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.036
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
Phosphorylation of receptor-like cytoplasmic kinases by bacterial flagellin.2010 · DOI: 10.4161/psb.11500
The Arabidopsis leucine-rich repeat receptor-like kinases BAK1/SERK3 and BKK1/SERK4 are required for innate immunity to hemibiotrophic and biotrophic pathogens.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084301
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
An RLP23-SOBIR1-BAK1 complex mediates NLP-triggered immunity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.140
The SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1093/jxb/ery454
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
At1g71830 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
Role of threonines in the Arabidopsis thaliana somatic embryogenesis receptor kinase 1 activation loop in phosphorylation.2001 · DOI: 10.1074/jbc.m102381200
In vivo hexamerization and characterization of the Arabidopsis AAA ATPase CDC48A complex using forster resonance energy transfer-fluorescence lifetime imaging microscopy and fluorescence correlation spectroscopy.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.103986
At1g34210 参与油菜素甾醇依赖和非依赖信号通路的丝氨酸/苏氨酸激酶。
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
At2g13790 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
BAK1 and BKK1 regulate brassinosteroid-dependent growth and brassinosteroid-independent cell-death pathways.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.036
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BB68 参与防御反应的 LRR 受体激酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017063 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0007030 Golgi organization 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0010227 floral organ abscission 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G34210
ath:AT1G71830
ath:AT4G33430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.666
排名 1 · LXL04_017063 · OH-1004
细胞质0.274
排名 2 · LXL04_017063 · OH-1004
细胞核0.210
排名 3 · LXL04_017063 · OH-1004
内质网0.044
排名 4 · LXL04_017063 · OH-1004
高尔基体0.035
排名 5 · LXL04_017063 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase40-323 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr41-325 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr409-678 aa
PF00069.32Pkinase409-676 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_017063PF00069.32Pkinase403231.5e-75254.7
LXL04_017063PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr413254.8e-86289.0
LXL04_017063PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4096784.8e-86289.0
LXL04_017063PF00069.32Pkinase4096761.5e-75254.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94F62拟南芥BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 168.466%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q94AG2拟南芥Somatic embryogenesis receptor kinase 166.857%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9XIC7拟南芥Somatic embryogenesis receptor kinase 266.857%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SKG5拟南芥Somatic embryogenesis receptor kinase 466.193%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
B8BB68水稻LRR receptor kinase BAK167.429%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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