RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_016985
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 138396057-138400914 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4161 bp · LXL04_016985|LXL04_016985|OH1004|cDNA

atgTGGATGTGGCGACGCCGTAAGCAAAATCGTTCGGACCGGTTATCCAAACCGCCCAATTTGCCAACCAAGACCGGATCCTCTAGCAAAGAAACCGGATCATCGTCCTCAAAGGGTCAAATTTGCCGTCGATTTACAATCGCTGAGATTCGATCCGCTACCCAAGACTTCAACCAAAGCTTGCTAATAGGGAGAGGCGGATTCGGGAGCGTGTACAAAGGTACAATCAAGGATGGAACACTACTCACGGTGGCTCTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

4161 bp · LXL04_016985|LXL04_016985|OH1004|CDS

ATGTGGATGTGGCGACGCCGTAAGCAAAATCGTTCGGACCGGTTATCCAAACCGCCCAATTTGCCAACCAAGACCGGATCCTCTAGCAAAGAAACCGGATCATCGTCCTCAAAGGGTCAAATTTGCCGTCGATTTACAATCGCTGAGATTCGATCCGCTACCCAAGACTTCAACCAAAGCTTGCTAATAGGGAGAGGCGGATTCGGGAGCGTGTACAAAGGTACAATCAAGGATGGAACACTACTCACGGTGGCTCTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1386 aa · LXL04_016985|LXL04_016985|OH1004|PROTEIN

MWMWRRRKQNRSDRLSKPPNLPTKTGSSSKETGSSSSKGQICRRFTIAEIRSATQDFNQSLLIGRGGFGSVYKGTIKDGTLLTVALKRWNFTSNQGVSEFEMEIDLLPMLRHPNIVYLIGFCNDGKELILVYEYMSNGSLKDHLHKHRTPLSWSQRLKICINVASALEYLHNGTSGQEVIYNNVKSANILLDDQWAAKIADFRISTIIPFDNDSTHVSTDVKGTLGYFDPEYAATGRLSKKSDVYSFGVVMLEVLCRRPP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_016985
TK1151 IDTkA02G085680
OH-1004 IDLXL04_016985
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_016985
位置Chr03:138396057-138400914 (+)
描述Similar to ANX2: Receptor-like protein kinase ANXUR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At3g04690 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At4g39110 可能的受体样蛋白激酶 At4g39110。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016985 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0030308 negative regulation of cell growth 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04690
ath:AT3G51550
ath:AT4G39110
ath:AT5G28680
ath:AT5G38990
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.497
排名 1 · LXL04_016985 · OH-1004
细胞质0.269
排名 2 · LXL04_016985 · OH-1004
细胞核0.263
排名 3 · LXL04_016985 · OH-1004
内质网0.064
排名 4 · LXL04_016985 · OH-1004
质体0.049
排名 5 · LXL04_016985 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase60-327 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr62-327 aa
PF23598.2LRR_14876-1146 aa
PF13855.13LRR_8897-955 aa
PF23247.2LRR_RPS21170-1259 aa
PF23247.2LRR_RPS21217-1331 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_016985PF00069.32Pkinase603272.5e-42145.8
LXL04_016985PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr623278.7e-45153.7
LXL04_016985PF23598.2LRR_1487611462.9e-1350.0
LXL04_016985PF13855.13LRR_88979551.5e-0731.8
LXL04_016985PF23247.2LRR_RPS2117012591.8e-1971.0
LXL04_016985PF23247.2LRR_RPS2121713311.8e-1971.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3E8W4拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR245.342%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FID9拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g3899045.821%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SCZ4拟南芥Receptor-like protein kinase FERONIA44.160%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SR05拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR145.625%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9T020拟南芥Probable receptor-like protein kinase At4g3911044.413%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

JBrowse

在基因组浏览器中查看