基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_016198
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 114933143-114938582
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4116 bp · LXL04_016198|LXL04_016198|OH1004|cDNA
ATGACATCAAACCAGAGCTTAAGAGATCTTCAATGGCTTCTTCAATCAATTCAAACTGAAAGTCTCGACCTTAAAAGCATCTCCTTCCATCTTTCTCAACCATCATCATGTTGTCATCAAGAAACCCAAGATTCGATTCATATAAACATTTCAAGCGATTCCCATTTCCAGTTTTCCAACATTATAACATCCCTTTCAACATCTCCCAAAACCCAAAATTTGCTGCAAAATCTCGAGTTTTATCAAGTTGAATGGCGGGT...
CDS
下载 CDS FASTA4116 bp · LXL04_016198|LXL04_016198|OH1004|CDS
ATGACATCAAACCAGAGCTTAAGAGATCTTCAATGGCTTCTTCAATCAATTCAAACTGAAAGTCTCGACCTTAAAAGCATCTCCTTCCATCTTTCTCAACCATCATCATGTTGTCATCAAGAAACCCAAGATTCGATTCATATAAACATTTCAAGCGATTCCCATTTCCAGTTTTCCAACATTATAACATCCCTTTCAACATCTCCCAAAACCCAAAATTTGCTGCAAAATCTCGAGTTTTATCAAGTTGAATGGCGGGT...
1371 aa · LXL04_016198|LXL04_016198|OH1004|PROTEIN
MTSNQSLRDLQWLLQSIQTESLDLKSISFHLSQPSSCCHQETQDSIHINISSDSHFQFSNIITSLSTSPKTQNLLQNLEFYQVEWRVEEMRGLEVLLDGSINVKQLEFKANRLNAECMKELSKILRKNETIKEVILSESRIGSLGATFIASALKVNSCLEELQIWEDAIGSKGAEELSKMIEANSTLKLLIIFDSSSITATPLISAVLARNRSMEVHLWSGERNKNNSSKVVEFAPESSTLRIYRLSTSGACRVTGALGW...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_016198 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G175270 |
| OH-1004 ID | LXL04_016198 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 98.700 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 100.000 / OH-1004 100.000覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_016198 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:114933143-114938582 (+) |
| 描述 | Similar to TRN1: Protein TORNADO 1 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000723 telomere maintenance 生物过程 GO:0007163 establishment or maintenance of cell polarity 生物过程 GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0007249 canonical NF-kappaB signal transduction 生物过程 GO:0007264 small GTPase-mediated signal transduction 生物过程 GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程 GO:0009926 auxin polar transport 生物过程 GO:0009933 meristem structural organization 生物过程 GO:0009956 radial pattern formation 生物过程 GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程 GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G55540 ddi:DDB_G0291079 hsa:197358 rno:499589 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.437
细胞核0.271
线粒体0.215
细胞膜0.179
内质网0.104
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF29255.1LRR_NLRC396-213 aaPF27087.1LRR_TMOD-LMOD97-189 aaPF29265.1LRR_CARMIL116-203 aaPF29255.1LRR_NLRC3245-451 aaPF27087.1LRR_TMOD-LMOD253-328 aaPF00025.28Arf490-575 aaPF08477.20Roc494-620 aaPF16095.12COR-A722-873 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_016198 | PF29255.1 | LRR_NLRC3 | 96 | 213 | 1.4e-26 | 93.9 |
| LXL04_016198 | PF27087.1 | LRR_TMOD-LMOD | 97 | 189 | 4.7e-21 | 75.8 |
| LXL04_016198 | PF29265.1 | LRR_CARMIL | 116 | 203 | 5e-11 | 42.7 |
| LXL04_016198 | PF29255.1 | LRR_NLRC3 | 245 | 451 | 1.4e-26 | 93.9 |
| LXL04_016198 | PF27087.1 | LRR_TMOD-LMOD | 253 | 328 | 4.7e-21 | 75.8 |
| LXL04_016198 | PF00025.28 | Arf | 490 | 575 | 3.7e-06 | 27.3 |
| LXL04_016198 | PF08477.20 | Roc | 494 | 620 | 1e-05 | 26.5 |
| LXL04_016198 | PF16095.12 | COR-A | 722 | 873 | 8.4e-09 | 36.2 |
| LXL04_016198 | PF25497.2 | COR-B | 895 | 1047 | 2.7e-13 | 50.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FJ57 | 拟南芥 | Protein TORNADO 1 | 64.523% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |