基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_015583
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 76818556-76830783
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4353 bp · LXL04_015583|LXL04_015583|OH1004|cDNA
ATGGAGGGTAGGGAGGGATTTAGAGTTAATAGTTCAAACATATGGAGGAACAGTGGTAGAGATTTCTTCTCAAGATCTTCACGTgaagaagacgatgaagaagCATTAAAATGGGCTGCAATTGAACGACTGCCCACTAATCTTCGATTACAGAGAGGCATACTGACCGAAGAAAAAGGCTGCCCGAAAGAGATTAATGTTAAGAATCTTGGATTGGTTGACAGAATGAATCTGTTAGAGAGGCTCGTTAAGATAGCAGA...
CDS
下载 CDS FASTA4353 bp · LXL04_015583|LXL04_015583|OH1004|CDS
ATGGAGGGTAGGGAGGGATTTAGAGTTAATAGTTCAAACATATGGAGGAACAGTGGTAGAGATTTCTTCTCAAGATCTTCACGTGAAGAAGACGATGAAGAAGCATTAAAATGGGCTGCAATTGAACGACTGCCCACTAATCTTCGATTACAGAGAGGCATACTGACCGAAGAAAAAGGCTGCCCGAAAGAGATTAATGTTAAGAATCTTGGATTGGTTGACAGAATGAATCTGTTAGAGAGGCTCGTTAAGATAGCAGA...
1450 aa · LXL04_015583|LXL04_015583|OH1004|PROTEIN
MEGREGFRVNSSNIWRNSGRDFFSRSSREEDDEEALKWAAIERLPTNLRLQRGILTEEKGCPKEINVKNLGLVDRMNLLERLVKIAEEDNEKFLMKLKQRIDRVGIRLPTIEVRFEHLNVDAEAYVGGRALPTIFNFLVNILEGSLNYLHLLPSRKKSLPILHDVSGIVKPGRMTLLLGPPSSGKTTLLLALAGKLGSDLQVSGKVTYNGHAMDEFVPQRTSAYISQYDLHIGEMTVRETLAFSARCQGVGANYEMLAEL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_015583 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_015583 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:76818556-76830783 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to PDR1: Pleiotropic drug resistance protein 1 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程 GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0009914 hormone transport 生物过程 GO:0010193 response to ozone 生物过程 GO:0010496 intercellular transport 生物过程 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G15520 dosa:Os01g0609300 nta:107799533 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.683
内质网0.153
细胞质0.107
溶酶体／液泡0.093
高尔基体0.066
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14510.12ABC_trans_N87-137 aaPF00005.34ABC_tran162-344 aaPF19055.7ABC2_membrane_7377-434 aaPF01061.30ABC2_membrane507-719 aaPF08370.17PDR_assoc724-786 aaPF00005.34ABC_tran881-1033 aaPF19055.7ABC2_membrane_71062-1122 aaPF01061.30ABC2_membrane1178-1392 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_015583 | PF14510.12 | ABC_trans_N | 87 | 137 | 5.4e-08 | 33.8 |
| LXL04_015583 | PF00005.34 | ABC_tran | 162 | 344 | 5.3e-40 | 137.9 |
| LXL04_015583 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 377 | 434 | 2.2e-14 | 53.9 |
| LXL04_015583 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 507 | 719 | 3.3e-108 | 360.8 |
| LXL04_015583 | PF08370.17 | PDR_assoc | 724 | 786 | 8.5e-29 | 99.8 |
| LXL04_015583 | PF00005.34 | ABC_tran | 881 | 1033 | 5.3e-40 | 137.9 |
| LXL04_015583 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 1062 | 1122 | 2.2e-14 | 53.9 |
| LXL04_015583 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 1178 | 1392 | 3.3e-108 | 360.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。