基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_015549
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 75530287-75531742
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1368 bp · LXL04_015549|LXL04_015549|OH1004|cDNA
ATGGAAGGAAAGCTTTACGAGGCATCTTTGACCGGGAACGTACAAGCACTCAATGCACTACTCCATGAAGACCAACTCATCCTTGACAGACTCTCACTCACCGCCTTCAATGAAACCCCACTCCACATCGCCGCCATGCGCGGCCACCTCCAATTTGCCACGGTGGTTCTGACCCAAAAGCCGAAACTTGCCATGGCCTTAGACAACCAAAGACGAACCCCACTCCACCTGGCCTCCGCCAATGGTAACTTGGAGATAGT...
CDS
下载 CDS FASTA1368 bp · LXL04_015549|LXL04_015549|OH1004|CDS
ATGGAAGGAAAGCTTTACGAGGCATCTTTGACCGGGAACGTACAAGCACTCAATGCACTACTCCATGAAGACCAACTCATCCTTGACAGACTCTCACTCACCGCCTTCAATGAAACCCCACTCCACATCGCCGCCATGCGCGGCCACCTCCAATTTGCCACGGTGGTTCTGACCCAAAAGCCGAAACTTGCCATGGCCTTAGACAACCAAAGACGAACCCCACTCCACCTGGCCTCCGCCAATGGTAACTTGGAGATAGT...
455 aa · LXL04_015549|LXL04_015549|OH1004|PROTEIN
MEGKLYEASLTGNVQALNALLHEDQLILDRLSLTAFNETPLHIAAMRGHLQFATVVLTQKPKLAMALDNQRRTPLHLASANGNLEIVQELIRLGSTSGDVCGVQDQDGLTPVHLAAMNEHLEVLKALIQANPQAAKEIPATGETILHMCVHYNRFEALKVLTELWNEEELAKITDHGGNTLLHAAAINKRIQILNFLLRIPSIKGNGNAVNRHGLTALDVLDQCPRDLQSLETQQILMEAGVLRANDLRPLPKSNLQPSA...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_015549 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_015549 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:75530287-75531742 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ITN1: Ankyrin repeat-containing protein ITN1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009651 response to salt stress 生物过程 GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程 GO:0045087 innate immune response 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G01680 ath:AT3G12360 ath:AT5G02620 ath:AT5G54610 dosa:Os01g0837000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.839
内质网0.100
细胞质0.074
细胞核0.041
溶酶体／液泡0.035
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF12796.14Ank_26-93 aaPF00023.37Ank72-94 aaPF12796.14Ank_2101-163 aaPF00023.37Ank107-134 aaPF13637.13Ank_4113-161 aaPF13637.13Ank_4146-198 aaPF13962.12PGG284-392 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_015549 | PF12796.14 | Ank_2 | 6 | 93 | 2.2e-29 | 102.6 |
| LXL04_015549 | PF00023.37 | Ank | 72 | 94 | 3.2e-25 | 87.5 |
| LXL04_015549 | PF12796.14 | Ank_2 | 101 | 163 | 2.2e-29 | 102.6 |
| LXL04_015549 | PF00023.37 | Ank | 107 | 134 | 3.2e-25 | 87.5 |
| LXL04_015549 | PF13637.13 | Ank_4 | 113 | 161 | 2.5e-22 | 79.1 |
| LXL04_015549 | PF13637.13 | Ank_4 | 146 | 198 | 2.5e-22 | 79.1 |
| LXL04_015549 | PF13962.12 | PGG | 284 | 392 | 2.3e-14 | 53.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9C7A2 | 拟南芥 | Ankyrin repeat-containing protein ITN1 | 28.329% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8GYH5 | 拟南芥 | Ankyrin repeat-containing protein BDA1 | 31.739% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q6AWW5 | 拟南芥 | Ankyrin repeat-containing protein At5g02620 | 28.571% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9ZU96 | 拟南芥 | Ankyrin repeat-containing protein At2g01680 | 27.083% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
A2CIR5 | 水稻 | Ankyrin repeat-containing protein NPR4 | 25.996% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |