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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_015405
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 71087488-71093507 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2706 bp · LXL04_015405|LXL04_015405|OH1004|cDNA

ATGTTTCTAATAAAAGACTTGGATCATCCTAGAATACCCTTTCAAGATATTAAAGTAGCCACCAAAAACTTCACAACCATCATCGGGAAGGGCGGATATGGACCTGTTTACACCGGAAAACTCTTACTTTCCGGCAATCTCACCTCCGTTGCTGTCAAACGACTACCAAGCATTAGCTTTTCTGGTCAAGGTCTCAAAGAGTTCTTAACAGAGATTCACTTGCTCTCTCGTTATAAACACCCAAATGTAGTCTCCCTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2706 bp · LXL04_015405|LXL04_015405|OH1004|CDS

ATGTTTCTAATAAAAGACTTGGATCATCCTAGAATACCCTTTCAAGATATTAAAGTAGCCACCAAAAACTTCACAACCATCATCGGGAAGGGCGGATATGGACCTGTTTACACCGGAAAACTCTTACTTTCCGGCAATCTCACCTCCGTTGCTGTCAAACGACTACCAAGCATTAGCTTTTCTGGTCAAGGTCTCAAAGAGTTCTTAACAGAGATTCACTTGCTCTCTCGTTATAAACACCCAAATGTAGTCTCCCTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

901 aa · LXL04_015405|LXL04_015405|OH1004|PROTEIN

MFLIKDLDHPRIPFQDIKVATKNFTTIIGKGGYGPVYTGKLLLSGNLTSVAVKRLPSISFSGQGLKEFLTEIHLLSRYKHPNVVSLLGYCEEGNEKILVYEYAKYGSFDKHLKTACQLTWKQRLNICIDAARGLDFLHNHIGAHHRVIHRDIKSANILLGQNWKAMIADFGLSKIGLTKENDTYLITNAGGTHGYCDPVYINTGILTKKSDVYSFGVVLFEALCGRLFFMDVVGEERLYVLRARRCYKEGKLNEIMDLNL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_015405
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_015405
位置Chr03:71087488-71093507 (-)
描述Similar to FER: Receptor-like protein kinase FERONIA
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51550 可能通过调节雌配子体助细胞中 MLO7 的极性定位，参与受精时对花粉管生长及雄配子递送的调控。
FERONIA receptor-like kinase regulates RHO GTPase signaling of root hair development.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005366107
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At3g04690 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015405 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G04690
ath:AT3G46290
ath:AT3G51550
ath:AT5G38990
ath:AT5G39000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.471
排名 1 · LXL04_015405 · OH-1004
细胞核0.291
排名 2 · LXL04_015405 · OH-1004
细胞膜0.266
排名 3 · LXL04_015405 · OH-1004
内质网0.089
排名 4 · LXL04_015405 · OH-1004
溶酶体／液泡0.076
排名 5 · LXL04_015405 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr25-290 aa
PF00069.32Pkinase26-290 aa
PF14299.14PP2453-581 aa
PF14299.14PP2665-818 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_015405PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr252901.3e-41143.4
LXL04_015405PF00069.32Pkinase262905.6e-42144.7
LXL04_015405PF14299.14PP24535817.5e-1762.4
LXL04_015405PF14299.14PP26658187.5e-1762.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SCZ4拟南芥Receptor-like protein kinase FERONIA49.667%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FID8拟南芥Putative receptor-like protein kinase At5g3900047.195%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 148.667%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SR05拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR147.697%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FID9拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g3899046.205%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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