基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_015400
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 70767122-70767566
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA312 bp · LXL04_015400|LXL04_015400|OH1004|cDNA
ATGGCCTTCCCCGATGCGATTCACGCATTTAAACCAAACCCTAAATCGCACATCCAGGAAGACAGGAGAATTCTCGATTTCCTATCCCACCATCCGGAAAGCTTAAACACCATGAGATTCTGGCTCGATGATGTTGGCATcctcttaattttttttataatcatcTTAGGTCTGTCAAATTCAATCATGGGTTTCTATTTGGGAAATCCAACACACGAACACAAAGGGTTTGCTAAATTTATCTTACATTCTGGCCTGTT...
CDS
下载 CDS FASTA312 bp · LXL04_015400|LXL04_015400|OH1004|CDS
ATGGCCTTCCCCGATGCGATTCACGCATTTAAACCAAACCCTAAATCGCACATCCAGGAAGACAGGAGAATTCTCGATTTCCTATCCCACCATCCGGAAAGCTTAAACACCATGAGATTCTGGCTCGATGATGTTGGCATCCTCTTAATTTTTTTTATAATCATCTTAGGTCTGTCAAATTCAATCATGGGTTTCTATTTGGGAAATCCAACACACGAACACAAAGGGTTTGCTAAATTTATCTTACATTCTGGCCTGTT...
103 aa · LXL04_015400|LXL04_015400|OH1004|PROTEIN
MAFPDAIHAFKPNPKSHIQEDRRILDFLSHHPESLNTMRFWLDDVGILLIFFIIILGLSNSIMGFYLGNPTHEHKGFAKFILHSGLLIAIIFNLGFQTISKNE
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_015400 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_015400 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:70767122-70767566 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to CAT2: Catalase isozyme 2 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。 水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程 GO:0007623 circadian rhythm 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009416 response to light stimulus 生物过程 GO:0009617 response to bacterium 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程 GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程 GO:1902074 response to salt 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005777 peroxisome 细胞组分 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | dosa:Os02g0115700 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
线粒体0.221
内质网0.206
质体0.184
细胞质0.126
高尔基体0.104
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00199.25Catalase1-47 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_015400 | PF00199.25 | Catalase | 1 | 47 | 8.6e-08 | 32.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。