LXL04_015369 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_015369

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 69843774-69847958 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1500 bp · LXL04_015369|LXL04_015369|OH1004|cDNA

ATGGCCATACACGAAGATCTTCTGGTTCCAATCCACTCCAAACTTGATGAGGTTTACGGTGATGGATCACAGCTCGAAGAGGCTCAACTTCGATTCTCCATTCTCAACTCTAAATTCAAAGAATTATTCGGTCATCTTCCTGACATCTATGCTCGCGCTCCAGGAAGAGTGAATTTAATTGGAGAACACATTGACTATGAGGGATATTCAGTGTTGCCCATGGCAATTAGGCAAGACACAATTGTAGCTATTCGGAAACG...

CDS

下载 CDS FASTA

1500 bp · LXL04_015369|LXL04_015369|OH1004|CDS

ATGGCCATACACGAAGATCTTCTGGTTCCAATCCACTCCAAACTTGATGAGGTTTACGGTGATGGATCACAGCTCGAAGAGGCTCAACTTCGATTCTCCATTCTCAACTCTAAATTCAAAGAATTATTCGGTCATCTTCCTGACATCTATGCTCGCGCTCCAGGAAGAGTGAATTTAATTGGAGAACACATTGACTATGAGGGATATTCAGTGTTGCCCATGGCAATTAGGCAAGACACAATTGTAGCTATTCGGAAACG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

499 aa · LXL04_015369|LXL04_015369|OH1004|PROTEIN

MAIHEDLLVPIHSKLDEVYGDGSQLEEAQLRFSILNSKFKELFGHLPDIYARAPGRVNLIGEHIDYEGYSVLPMAIRQDTIVAIRKRDAGESEKLLRIANVNDKYTMCTYPVDPDQEIDLKNHRWGHYFICGYKGFHEYAKSVGLDVGLPVGLDVIIDGTVPTGSGLSSSAAFVCSSTIAIMAALNVNLPKKEVAQLTCECERHIGTQSGGMDQAISIMAKTGFAELIDFNPIRATDVQLPAGGSFVIAHSLAESQKAVT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_015369`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_015369

位置 Chr03:69843774-69847958 (-)

描述 Similar to GAL1: Galactokinase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g06580`	糖-1-激酶，对 D-半乳糖（D-Gal）的 α 异构形式具有非常高的底物特异性。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015369 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程

GO:0006012 galactose metabolic process 生物过程

GO:0019388 galactose catabolic process 生物过程

GO:0046835 carbohydrate phosphorylation 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004335 galactokinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0033858 N-acetylgalactosamine kinase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G06580

ddi:DDB_G0292112

hsa:2585

mmu:69976

rno:296117

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.808

排名 1 · LXL04_015369 · OH-1004

细胞核0.322

排名 2 · LXL04_015369 · OH-1004

线粒体0.082

排名 3 · LXL04_015369 · OH-1004

过氧化物酶体0.080

排名 4 · LXL04_015369 · OH-1004

内质网0.037

排名 5 · LXL04_015369 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10509.16GalKase_gal_bdg38-86 aa

PF00288.33GHMP_kinases_N144-220 aa

PF08544.19GHMP_kinases_C394-467 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_015369	`PF10509.16`	GalKase_gal_bdg	38	86	1.3e-23	83.0
LXL04_015369	`PF00288.33`	GHMP_kinases_N	144	220	7.6e-17	62.0
LXL04_015369	`PF08544.19`	GHMP_kinases_C	394	467	6.1e-16	59.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SEE5`	拟南芥	Galactokinase	75.150%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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