LXL04_015051 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_015051

当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 62633836-62635293 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1458 bp · LXL04_015051|LXL04_015051|OH1004|cDNA

ATGGATTCTCActtctttctctttctctctctactCACACTCTCCGCTACCGTCACCGtcaccgccaccgccaccgccaccgtcAGCACACTCAACGTTGCGTCAGCTGTCCAGAAAACTCTCGACCTCCTAAACCCCACTTTACTCCAAGAACATGTTGAAAAAACCACACCTGAATCTACCTCTTCGTCATTGTCTTTCACCCTCCATCCTCGATCCTCTATCCACCAtacccaccaccaccaccatgaTTACGCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1458 bp · LXL04_015051|LXL04_015051|OH1004|CDS

ATGGATTCTCACTTCTTTCTCTTTCTCTCTCTACTCACACTCTCCGCTACCGTCACCGTCACCGCCACCGCCACCGCCACCGTCAGCACACTCAACGTTGCGTCAGCTGTCCAGAAAACTCTCGACCTCCTAAACCCCACTTTACTCCAAGAACATGTTGAAAAAACCACACCTGAATCTACCTCTTCGTCATTGTCTTTCACCCTCCATCCTCGATCCTCTATCCACCATACCCACCACCACCACCATGATTACGCATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

485 aa · LXL04_015051|LXL04_015051|OH1004|PROTEIN

MDSHFFLFLSLLTLSATVTVTATATATVSTLNVASAVQKTLDLLNPTLLQEHVEKTTPESTSSSLSFTLHPRSSIHHTHHHHHDYASLTLSRLARDSHRVTSLTTKLNFALAGTNKSELKPAVETDSMLRPEDLSTPVSSGISQGSGEYFARVGLGTPVQLYYMVIDTGSDINWLQCQPCSDCYQQTDPIFNPSASTSYSTLSCSSQQCSSLEITACRSEVCLYQVSYGDGSFTVGDFVTETVTFGKSGSVPKVAMGCGH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_015051`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_015051

位置 Chr03:62633836-62635293 (-)

描述 Similar to ASPG1: Protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g18490`	天冬氨酸蛋白酶通过脱落酸信号传导参与避免干旱。	Overexpression of the aspartic protease ASPG1 gene confers drought avoidance in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err433
`At1g01300`	天冬氨酰蛋白酶。	暂无已核实直接文献
`At3g20015`	天冬氨酸蛋白酶，可能通过脱落酸信号参与干旱规避。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015051 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006508 proteolysis 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程

GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0003677 DNA binding 分子功能

GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能

GO:0070001 aspartic-type peptidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G01300

ath:AT3G18490

ath:AT3G20015

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.498

排名 1 · LXL04_015051 · OH-1004

细胞膜0.169

排名 2 · LXL04_015051 · OH-1004

内质网0.140

排名 3 · LXL04_015051 · OH-1004

细胞质0.083

排名 4 · LXL04_015051 · OH-1004

溶酶体／液泡0.077

排名 5 · LXL04_015051 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00026.29Asp148-481 aa

PF14543.12TAXi_N149-308 aa

PF14541.12TAXi_C332-481 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_015051	`PF00026.29`	Asp	148	481	2.9e-18	67.1
LXL04_015051	`PF14543.12`	TAXi_N	149	308	6.2e-48	164.0
LXL04_015051	`PF14541.12`	TAXi_C	332	481	2e-35	122.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LS40`	拟南芥	Protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1	56.426%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9LNJ3`	拟南芥	Aspartyl protease family protein 2	55.087%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9LHE3`	拟南芥	Protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 2	42.484%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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