基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_013766
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 35658415-35669129
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1743 bp · LXL04_013766|LXL04_013766|OH1004|cDNA
ATGGTTGAAGAAAGGTACGCCACAGGAGTCACGAAGTGTACGCATTCACAGACAGGAAGAAAGGGGAACAAGAACGATAGAAGACAGATAACCACAATCGAAATTAAAGAAATTCCGGATACAGATAGGGCTGAATCGAGTACCGGAAATTTCGCAAGCATGTGGTGGGCAGACCTAAAAGCAGCAATAGGGCAATGGATTAACGTCGAGGGACTGCTGTTTTCGGTATCGGTGATTACTAGAAACAAGAAATGGGTGAT...
CDS
下载 CDS FASTA1743 bp · LXL04_013766|LXL04_013766|OH1004|CDS
ATGGTTGAAGAAAGGTACGCCACAGGAGTCACGAAGTGTACGCATTCACAGACAGGAAGAAAGGGGAACAAGAACGATAGAAGACAGATAACCACAATCGAAATTAAAGAAATTCCGGATACAGATAGGGCTGAATCGAGTACCGGAAATTTCGCAAGCATGTGGTGGGCAGACCTAAAAGCAGCAATAGGGCAATGGATTAACGTCGAGGGACTGCTGTTTTCGGTATCGGTGATTACTAGAAACAAGAAATGGGTGAT...
580 aa · LXL04_013766|LXL04_013766|OH1004|PROTEIN
MVEERYATGVTKCTHSQTGRKGNKNDRRQITTIEIKEIPDTDRAESSTGNFASMWWADLKAAIGQWINVEGLLFSVSVITRNKKWVMPHLSVRDIRYIDWAALRRKGYEGVVFDKDNTLTAPYSLALWGPLAASVESYRSVFGNNIVVFSNSAGLEEYDPDGRKARALEYVIGIRVIRHILTNVFVYVTLEMKKPAGSAEEIEKHFGCDSSKLIMVGDRPFTDIVYGNGIFVRCDNDRDGALSDAELKDFQVKCFNAPLQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_013766 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_013766 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:35658415-35669129 (+) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to MIRO1: Mitochondrial Rho GTPase 1 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006655 phosphatidylglycerol biosynthetic process 生物过程 GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程 GO:0008610 lipid biosynthetic process 生物过程 GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0009860 pollen tube growth 生物过程 GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程 GO:0015979 photosynthesis 生物过程 GO:0019725 cellular homeostasis 生物过程 GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程 GO:0046839 phospholipid dephosphorylation 生物过程 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G05310 ath:AT3G58830 ath:AT3G63150 ath:AT5G27540 dre:327143 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
线粒体0.237
细胞质0.233
内质网0.182
细胞核0.149
质体0.135
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF09419.17PGP_phosphatase74-228 aaPF08356.19EF_assoc_2258-342 aaPF08355.18EF_assoc_1378-436 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_013766 | PF09419.17 | PGP_phosphatase | 74 | 228 | 3.7e-35 | 121.7 |
| LXL04_013766 | PF08356.19 | EF_assoc_2 | 258 | 342 | 9.4e-30 | 103.2 |
| LXL04_013766 | PF08355.18 | EF_assoc_1 | 378 | 436 | 1.2e-19 | 70.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8RXF8 | 拟南芥 | Mitochondrial Rho GTPase 1 | 56.970% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
F4J0W4 | 拟南芥 | Mitochondrial Rho GTPase 2 | 56.911% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9MA88 | 拟南芥 | Mitochondrial Rho GTPase 3 | 53.012% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LXR9 | 拟南芥 | Phosphatidylglycerophosphate phosphatase 1, chloroplastic/mitochondrial | 65.537% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |