基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_013311
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 27580180-27586293
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4149 bp · LXL04_013311|LXL04_013311|OH1004|cDNA
ATGTATGGGCAGTGGGAAGGTGAGTTGTGGTTCCACCGGCGGCACATGTGGTCGGTCCCCTCTCCCTCCACGCCGTCTCTAGTCGCTCCCATCAAGTCCTCCGTATTCATCGACTCTAACGCTTTCTCCAAAGATGGACGCAAGATTCATGTTGGTGACTGTGCACTGTTCGAACCACCTCATGATTCCCCTCCATTTGTTGGACTAATTCGTAAATTAACAGTAGATAAAGACGATAATCTGAGCCTAAGTGTGAATTG...
CDS
下载 CDS FASTA4149 bp · LXL04_013311|LXL04_013311|OH1004|CDS
ATGTATGGGCAGTGGGAAGGTGAGTTGTGGTTCCACCGGCGGCACATGTGGTCGGTCCCCTCTCCCTCCACGCCGTCTCTAGTCGCTCCCATCAAGTCCTCCGTATTCATCGACTCTAACGCTTTCTCCAAAGATGGACGCAAGATTCATGTTGGTGACTGTGCACTGTTCGAACCACCTCATGATTCCCCTCCATTTGTTGGACTAATTCGTAAATTAACAGTAGATAAAGACGATAATCTGAGCCTAAGTGTGAATTG...
1382 aa · LXL04_013311|LXL04_013311|OH1004|PROTEIN
MYGQWEGELWFHRRHMWSVPSPSTPSLVAPIKSSVFIDSNAFSKDGRKIHVGDCALFEPPHDSPPFVGLIRKLTVDKDDNLSLSVNWLYRPSDVKLVKGASLEAAPNEVFYSFHQDEILAASLLHPCKVAFLRKGVELPSRVSSFVCRRVYDVQTKRLWWLTDQDYRNDRQEVVNQLLDKTRVEMYGSHSPKTLNGQVKGKKREQSSDPGQLRPEDMLKAEIAKITDKGGLVDFEGVEKIIQLMQPESGDKKVDLASRIM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_013311 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_013311 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:27580180-27586293 (-) |
| 描述 | Similar to At5g39000: Putative receptor-like protein kinase At5g39000 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程 GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009791 post-embryonic development 生物过程 GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程 GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010038 response to metal ion 生物过程 GO:0010118 stomatal movement 生物过程 GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程 GO:0010483 pollen tube reception 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G46290 ath:AT3G51550 ath:AT5G28680 ath:AT5G38990 ath:AT5G39000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.952
细胞质0.094
细胞膜0.043
内质网0.024
质体0.016
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF01426.25BAH48-158 aaPF08711.17Med26317-366 aaPF00069.32Pkinase1226-1314 aaPF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr1227-1313 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_013311 | PF01426.25 | BAH | 48 | 158 | 2.8e-17 | 63.5 |
| LXL04_013311 | PF08711.17 | Med26 | 317 | 366 | 3.6e-14 | 53.0 |
| LXL04_013311 | PF00069.32 | Pkinase | 1226 | 1314 | 1.4e-16 | 61.4 |
| LXL04_013311 | PF07714.24 | PK_Tyr_Ser-Thr | 1227 | 1313 | 3.7e-17 | 63.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9FID8 | 拟南芥 | Putative receptor-like protein kinase At5g39000 | 43.750% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SCZ4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase FERONIA | 42.690% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FID9 | 拟南芥 | Probable receptor-like protein kinase At5g38990 | 43.750% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q3E8W4 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase ANXUR2 | 43.275% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9LX66 | 拟南芥 | Receptor-like protein kinase HERK 1 | 44.379% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |