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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_013275
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 26919215-26921122 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1242 bp · LXL04_013275|LXL04_013275|OH1004|cDNA

ATGGAGAGCTATGCATTAGCTCTTTCTAGCTCTACTCTGAATCCAAAATCCCTAAAGCATCTCAACCCAAATACACTACCCAAAACCTTACCAATTtgttcatcatcatcatcatctctcCATTTATTATGCAATAGTAACTATAAAACCACAAGTTCACATACAAGGTTCCCATTTGGCTCTTACTCACCCCAAAATTTCAATTCGTTTTTGTTTCCAAAAGAAGCCCGAAATGATTTGGTGGTGGTCAGAGCTGCCGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1242 bp · LXL04_013275|LXL04_013275|OH1004|CDS

ATGGAGAGCTATGCATTAGCTCTTTCTAGCTCTACTCTGAATCCAAAATCCCTAAAGCATCTCAACCCAAATACACTACCCAAAACCTTACCAATTTGTTCATCATCATCATCATCTCTCCATTTATTATGCAATAGTAACTATAAAACCACAAGTTCACATACAAGGTTCCCATTTGGCTCTTACTCACCCCAAAATTTCAATTCGTTTTTGTTTCCAAAAGAAGCCCGAAATGATTTGGTGGTGGTCAGAGCTGCCGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

413 aa · LXL04_013275|LXL04_013275|OH1004|PROTEIN

MESYALALSSSTLNPKSLKHLNPNTLPKTLPICSSSSSSLHLLCNSNYKTTSSHTRFPFGSYSPQNFNSFLFPKEARNDLVVVRAAASAPESESSGDSANPAEFGRSLQLAAMFGVWYILNIYFNIFNKQVLKVFPYPMTVTTFQFGCGTLMILIMWALKLHPRPKIYKSQIVPVLMLAVAHTMGNLLTNISLGRVAVSFTHTIKAMEPFFTVLFSALLLSERPTLWVVASLVPIVGGVALASFTEASFNWIGFGSAMAS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_013275
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_013275
位置Chr03:26919215-26921122 (+)
描述Similar to PPT2: Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01550 磷酸烯醇丙酮酸/磷酸转运蛋白，转运磷酸烯醇丙酮酸（PEP）、2-磷酸甘油酸和3-磷酸甘油酸。
Characterization of two functional phosphoenolpyruvate/phosphate translocator (PPT) genes in Arabidopsis--AtPPT1 may be involved in the provision of signals for correct mesophyll development.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01888.x
At5g33320 磷酸烯醇丙酮酸/磷酸盐转运蛋白，可运输磷酸烯醇丙酮酸 、2-磷酸甘油酸、3-磷酸甘油酸和二羟基丙酮磷酸盐。
The phosphoenolpyruvate/phosphate translocator is required for phenolic metabolism, palisade cell development, and plastid-dependent nuclear gene expression.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.9.1609
The phenotype of the Arabidopsis cue1 mutant is not simply caused by a general restriction of the shikimate pathway.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01889.x
Characterization of two functional phosphoenolpyruvate/phosphate translocator (PPT) genes in Arabidopsis--AtPPT1 may be involved in the provision of signals for correct mesophyll development.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01888.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0344600 磷酸烯醇丙酮酸/磷酸转运蛋白，运输磷酸烯醇丙酮酸（PEP）和二羟基丙酮磷酸。 暂无已核实直接文献
Os09g0297400 磷酸烯醇丙酮酸/磷酸转运蛋白，运输磷酸烯醇丙酮酸（PEP）和二羟基丙酮磷酸。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013275 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0015713 phosphoglycerate transmembrane transport 生物过程
GO:0015714 phosphoenolpyruvate transport 生物过程
GO:0035436 triose phosphate transmembrane transport 生物过程
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009528 plastid inner membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0031969 chloroplast membrane 细胞组分
GO:0009670 triose-phosphate:phosphate antiporter activity 分子功能
GO:0015120 phosphoglycerate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G01550
ath:AT5G33320
dosa:Os08g0344600
dosa:Os09g0297400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.970
排名 1 · LXL04_013275 · OH-1004
高尔基体0.038
排名 2 · LXL04_013275 · OH-1004
内质网0.037
排名 3 · LXL04_013275 · OH-1004
过氧化物酶体0.032
排名 4 · LXL04_013275 · OH-1004
线粒体0.016
排名 5 · LXL04_013275 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03151.23TPT108-401 aa
PF00892.27EamA126-243 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_013275PF03151.23TPT1084012.8e-122408.4
LXL04_013275PF00892.27EamA1262435.1e-1659.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H0T6拟南芥Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 2, chloroplastic72.561%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q8RXN3拟南芥Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 1, chloroplastic63.526%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q84QU8水稻Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 2, chloroplastic65.782%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q69VR7水稻Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 1, chloroplastic69.805%Swiss-Prot强数据库同源证据

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