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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_013223
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 26288888-26292140 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2322 bp · LXL04_013223|LXL04_013223|OH1004|cDNA

ATGGGGTGGTACTGCTCGAATTTGGTGTTATTCATGCTGTTTCTTTCATGGGGTTTCTTTTTCTCAAGCACACATCAATTACAATCAACTCAAACTCAGGTTCTTCTCCAACTCAGGAAACATTTGGAGTACCCATTGCAATTAAGCAATTGGGAGAATTACAATGGTGATTTTTGTAATTTGGTTTCAAATCCACAAGTTAGCATCAAATGTGAAGGTAATTCGATCTCCGAGCTCAAGATCATGGGAGATAAGCTTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2322 bp · LXL04_013223|LXL04_013223|OH1004|CDS

ATGGGGTGGTACTGCTCGAATTTGGTGTTATTCATGCTGTTTCTTTCATGGGGTTTCTTTTTCTCAAGCACACATCAATTACAATCAACTCAAACTCAGGTTCTTCTCCAACTCAGGAAACATTTGGAGTACCCATTGCAATTAAGCAATTGGGAGAATTACAATGGTGATTTTTGTAATTTGGTTTCAAATCCACAAGTTAGCATCAAATGTGAAGGTAATTCGATCTCCGAGCTCAAGATCATGGGAGATAAGCTTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

773 aa · LXL04_013223|LXL04_013223|OH1004|PROTEIN

MGWYCSNLVLFMLFLSWGFFFSSTHQLQSTQTQVLLQLRKHLEYPLQLSNWENYNGDFCNLVSNPQVSIKCEGNSISELKIMGDKLKKVGDFHGYAVQNRTLSKTFSIDSLVVTLARLNTLRVLSLVSLGIWGPFPEKIHRLSSLELLDMSSNFLFGSIPNEISRLVKLRTLTLDGNFFNESIPNWFDSLSNLTILSLKNNKFNGQFPSSIRKITTLAAIALSHNNLNGKLPDLTTLTSLNLLDLRDNHFDSELPFLPKG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_013223
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_013223
位置Chr03:26288888-26292140 (-)
描述Similar to At3g03770: Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g03770 可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At3g03770。 暂无已核实直接文献
At1g14390 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g14390。 暂无已核实直接文献
At2g02780 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g02780。 暂无已核实直接文献
At5g07280 具有丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶活性的受体，决定雄性孢原细胞起始细胞的正确数量，并进一步决定绒毡层和中间层细胞的特性。 暂无已核实直接文献
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013223 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010234 anther wall tapetum cell fate specification 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019199 transmembrane receptor protein kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14390
ath:AT2G02780
ath:AT3G03770
ath:AT5G07280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.832
排名 1 · LXL04_013223 · OH-1004
内质网0.076
排名 2 · LXL04_013223 · OH-1004
细胞质0.066
排名 3 · LXL04_013223 · OH-1004
细胞核0.051
排名 4 · LXL04_013223 · OH-1004
溶酶体／液泡0.038
排名 5 · LXL04_013223 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14114-221 aa
PF13855.13LRR_8120-177 aa
PF13855.13LRR_8184-227 aa
PF13855.13LRR_8261-319 aa
PF00069.32Pkinase492-652 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr494-752 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_013223PF23598.2LRR_141142211.7e-1144.2
LXL04_013223PF13855.13LRR_81201776e-1658.7
LXL04_013223PF13855.13LRR_81842276e-1658.7
LXL04_013223PF13855.13LRR_82613196e-1658.7
LXL04_013223PF00069.32Pkinase4926522.1e-1351.0
LXL04_013223PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr4947523.8e-1969.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LFN2拟南芥Probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g0377041.724%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M9S4拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1439031.777%Swiss-Prot中等数据库同源证据
C0LGJ9拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g0278032.597%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LYN8拟南芥Leucine-rich repeat receptor protein kinase EMS129.612%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
C0LGQ5拟南芥LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO128.060%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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