基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_013008
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 22198055-22201760
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA2568 bp · LXL04_013008|LXL04_013008|OH1004|cDNA
ATGGCGGAAACACCAAAGAAGCTCAGGCAAACCCCACAAAAAGCACCCAAATCGTCTCCTAAAACTCCGATTCCCCAGACGCCACAAACCCTAGCATCACCTCGGCGCAGCTCCCGTTTCATATCTTCACCACTTCCGCAATGTCAAACCACATCACCTGTGAACGCTTTAAAAACTTCAATCAATCGAAGGACTAAGTCTGCGGTGAATGCTGCTAGGTCGAAGAAGAAATTAGACTTGACCGATTCAGTCAAGGTCGA...
CDS
下载 CDS FASTA2568 bp · LXL04_013008|LXL04_013008|OH1004|CDS
ATGGCGGAAACACCAAAGAAGCTCAGGCAAACCCCACAAAAAGCACCCAAATCGTCTCCTAAAACTCCGATTCCCCAGACGCCACAAACCCTAGCATCACCTCGGCGCAGCTCCCGTTTCATATCTTCACCACTTCCGCAATGTCAAACCACATCACCTGTGAACGCTTTAAAAACTTCAATCAATCGAAGGACTAAGTCTGCGGTGAATGCTGCTAGGTCGAAGAAGAAATTAGACTTGACCGATTCAGTCAAGGTCGA...
855 aa · LXL04_013008|LXL04_013008|OH1004|PROTEIN
MAETPKKLRQTPQKAPKSSPKTPIPQTPQTLASPRRSSRFISSPLPQCQTTSPVNALKTSINRRTKSAVNAARSKKKLDLTDSVKVDDAFSPVSPDRTETKKRKSKIDNAGDEVKAKVSRNDQQKGKKKDSTKPKRRVYYKKVSYDGGLFSVGDDVYVKRREDASSDDDDPEVEECRVCFKAGRLIMIECDDCLGGFHLKCLKPPLKSVPDGDWICTYCEAKKSGKKLELPSVFEGKRRRRTAKEKLLSSDLWAVRIQSL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_013008 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_013008 |
|---|---|
| 位置 | Chr03:22198055-22201760 (-) |
| 描述 | Similar to ORC1A: Origin of replication complex subunit 1A |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006260 DNA replication 生物过程 GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程 GO:0006277 DNA amplification 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程 GO:0009744 response to sucrose 生物过程 GO:0033314 mitotic DNA replication checkpoint signaling 生物过程 GO:0000781 chromosome, telomeric region 细胞组分 GO:0000808 origin recognition complex 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G12620 ath:AT4G14700 dme:Dmel_CG10667 dosa:Os06g0187000 hsa:4998 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.946
细胞质0.096
细胞膜0.025
线粒体0.015
内质网0.014
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00628.36PHD176-219 aaPF01426.25BAH255-302 aaPF13191.13AAA_16478-622 aaPF13401.13AAA_22504-631 aaPF00004.36AAA507-652 aaPF22606.3Cdc6-ORC-like_ATPase_lid660-713 aaPF17872.8AAA_lid_10680-717 aaPF09079.18WHD_Cdc6749-841 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_013008 | PF00628.36 | PHD | 176 | 219 | 1e-07 | 32.6 |
| LXL04_013008 | PF01426.25 | BAH | 255 | 302 | 2.2e-10 | 41.2 |
| LXL04_013008 | PF13191.13 | AAA_16 | 478 | 622 | 9.4e-10 | 40.0 |
| LXL04_013008 | PF13401.13 | AAA_22 | 504 | 631 | 2.6e-10 | 41.4 |
| LXL04_013008 | PF00004.36 | AAA | 507 | 652 | 2.5e-17 | 64.3 |
| LXL04_013008 | PF22606.3 | Cdc6-ORC-like_ATPase_lid | 660 | 713 | 8.9e-08 | 32.6 |
| LXL04_013008 | PF17872.8 | AAA_lid_10 | 680 | 717 | 5.8e-11 | 43.1 |
| LXL04_013008 | PF09079.18 | WHD_Cdc6 | 749 | 841 | 6.2e-09 | 36.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。