基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_012653
当前版本: OH-1004
染色体: Chr03
坐标: 16308137-16310342
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1389 bp · LXL04_012653|LXL04_012653|OH1004|cDNA
ATGTTGGACCTTAATCTGAGTGTTGATCAGAGCGGTTTGATGTCAAAATATGCAGAGGACGATAGCGGTAAGCAGCTTCTCGAGGTATGCGGCAGCGGCGGTCAGTTGGAACACTCCGGCGGTACCTCGAATTCCTCCGTCGTCAATGTAGAGATATCGAGTAACGCTGGCGATGAGGAGCACTCGTACTCATGTCCAGATTTCGCTTATAGCTTCGATATATTGAAACCTGGTCACCGAGAAGATAATCAGAATTTTAG...
CDS
下载 CDS FASTA1389 bp · LXL04_012653|LXL04_012653|OH1004|CDS
ATGTTGGACCTTAATCTGAGTGTTGATCAGAGCGGTTTGATGTCAAAATATGCAGAGGACGATAGCGGTAAGCAGCTTCTCGAGGTATGCGGCAGCGGCGGTCAGTTGGAACACTCCGGCGGTACCTCGAATTCCTCCGTCGTCAATGTAGAGATATCGAGTAACGCTGGCGATGAGGAGCACTCGTACTCATGTCCAGATTTCGCTTATAGCTTCGATATATTGAAACCTGGTCACCGAGAAGATAATCAGAATTTTAG...
462 aa · LXL04_012653|LXL04_012653|OH1004|PROTEIN
MLDLNLSVDQSGLMSKYAEDDSGKQLLEVCGSGGQLEHSGGTSNSSVVNVEISSNAGDEEHSYSCPDFAYSFDILKPGHREDNQNFRSGSVVTKQFFPETDGDEGLQQHQLLEAVNGSAVDERDFMLRQQHKQQVRKSRRGPRPRSSQYRGVTFYRRTGRWESHIWDSGKQVYLGGFDTAHAAARAYDRAAIKFRGVDADINFNITDYEDDLKQIKNLTKEEFVHILRRQSTGFSRGSSKYRGVTLHKCGRWEARMGQFL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_012653 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_012653 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr03:16308137-16310342 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to AP2-2: APETALA2-like protein 2 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0009909 regulation of flower development 生物过程 GO:0010073 meristem maintenance 生物过程 GO:0010093 specification of floral organ identity 生物过程 GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程 GO:0030154 cell differentiation 生物过程 GO:0048316 seed development 生物过程 GO:0048481 plant ovule development 生物过程 GO:0080050 regulation of seed development 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G36920 dosa:Os07g0235800 osa:4334582 osa:4342787 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.968
细胞质0.075
细胞膜0.027
质体0.018
内质网0.018
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00847.27AP2148-196 aaPF00847.27AP2239-289 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_012653 | PF00847.27 | AP2 | 148 | 196 | 7.1e-21 | 75.0 |
| LXL04_012653 | PF00847.27 | AP2 | 239 | 289 | 7.1e-21 | 75.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
P47927 | 拟南芥 | Floral homeotic protein APETALA 2 | 67.460% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
B8AMA9 | 水稻 | APETALA2-like protein 2 | 59.459% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q84TB5 | 水稻 | APETALA2-like protein 2 | 59.459% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8H443 | 水稻 | APETALA2-like protein 3 | 53.708% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
B8B8J2 | 水稻 | APETALA2-like protein 3 | 60.333% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |