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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_012388
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 11503701-11505741 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1350 bp · LXL04_012388|LXL04_012388|OH1004|cDNA

ATGGCTAGTATGTGTTGTGGTGTTGTTGGTGAGACAAAGACGACATCGCCGGTTGAGCCTAGCGGTGGTCGTCAAGGGAGACGTCGTCGCATGGAAATTCAACAGCTTAAATTCCTAGCGGCTGCGGCCTCTGATGTGGTGATGTCTCCACCTGACAGTACCAGGAAGCGTAGAAAGGTTGGAAGTATCGGGACGATTGAAACTACCGGTGATGATGTGATTTTGTCTAGGCCGGGAGAATTCGAGAACGCAGTCCAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

1350 bp · LXL04_012388|LXL04_012388|OH1004|CDS

ATGGCTAGTATGTGTTGTGGTGTTGTTGGTGAGACAAAGACGACATCGCCGGTTGAGCCTAGCGGTGGTCGTCAAGGGAGACGTCGTCGCATGGAAATTCAACAGCTTAAATTCCTAGCGGCTGCGGCCTCTGATGTGGTGATGTCTCCACCTGACAGTACCAGGAAGCGTAGAAAGGTTGGAAGTATCGGGACGATTGAAACTACCGGTGATGATGTGATTTTGTCTAGGCCGGGAGAATTCGAGAACGCAGTCCAATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

449 aa · LXL04_012388|LXL04_012388|OH1004|PROTEIN

MASMCCGVVGETKTTSPVEPSGGRQGRRRRMEIQQLKFLAAAASDVVMSPPDSTRKRRKVGSIGTIETTGDDVILSRPGEFENAVQSSDTKQADVGPCARGDCETSSESLREESSRFGLTVVCGRRRDLEDAVAVKPSFCRTSSRSCDDLNFYGVYDGHGCSHVAMKCKDRMHEIVKEEVVNSGNSIEWREAMVKSFSRMDKDITDWSNSTSRSNCRCELQTPQCDAVGSTAVVAVLTPEKIVVSNCGDSRAVLCRNGVA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_012388
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_012388
位置Chr03:11503701-11505741 (+)
描述Similar to AIP1: Protein phosphatase 2C 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07430 通过去磷酸化作用参与K(+)钾通道AKT1的负调控，与CIPK蛋白（如CIPK23）相反。 暂无已核实直接文献
At3g11410 种子萌发和冷驯化过程中脱落酸 反应的主要负调节因子。
Antisense inhibition of protein phosphatase 2C accelerates cold acclimation in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01048.x
Physical and functional interaction of the Arabidopsis K(+) channel AKT2 and phosphatase AtPP2CA.2002 · DOI: 10.1105/tpc.000943
ABA-hypersensitive germination3 encodes a protein phosphatase 2C (AtPP2CA) that strongly regulates abscisic acid signaling during germination among Arabidopsis protein phosphatase 2Cs.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070128
The protein phosphatase AtPP2CA negatively regulates abscisic acid signal transduction in Arabidopsis, and effects of abh1 on AtPP2CA mRNA.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.070318
ABA-Hypersensitive Germination1 encodes a protein phosphatase 2C, an essential component of abscisic acid signaling in Arabidopsis seed.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03107.x
ABI1 and PP2CA phosphatases are negative regulators of Snf1-related protein kinase1 signaling in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.114066
At2g29380 可能的蛋白质磷酸酶 2C 24。 暂无已核实直接文献
At5g59220 作为叶片中脱落酸(ABA)信号导致气孔关闭的负调控因子，并控制叶片衰老期间的水分流失。
An ABA-regulated and Golgi-localized protein phosphatase controls water loss during leaf senescence in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04821.x
An abscisic acid-AtNAP transcription factor-SAG113 protein phosphatase 2C regulatory chain for controlling dehydration in senescing Arabidopsis leaves.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.190876
Selective inhibition of clade A phosphatases type 2C by PYR/PYL/RCAR abscisic acid receptors.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.188623
Unique drought resistance functions of the highly ABA-induced clade A protein phosphatase 2Cs.2012 · DOI: 10.1104/pp.112.202408

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0846300 可能的蛋白质磷酸酶2C 9。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012388 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010360 negative regulation of anion channel activity 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07430
ath:AT2G29380
ath:AT3G11410
ath:AT5G59220
dosa:Os01g0846300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.705
排名 1 · LXL04_012388 · OH-1004
细胞质0.303
排名 2 · LXL04_012388 · OH-1004
细胞膜0.075
排名 3 · LXL04_012388 · OH-1004
内质网0.040
排名 4 · LXL04_012388 · OH-1004
质体0.031
排名 5 · LXL04_012388 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00481.27PP2C117-401 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_012388PF00481.27PP2C1174011.5e-64218.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LNW3拟南芥Protein phosphatase 2C 363.344%Swiss-Prot中等数据库同源证据
P49598拟南芥Protein phosphatase 2C 3758.516%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9ZW21拟南芥Probable protein phosphatase 2C 2463.123%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FIF5拟南芥Probable protein phosphatase 2C 7860.915%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q5N9N2水稻Probable protein phosphatase 2C 960.883%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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