基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_011514
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 165945132-165947369
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1857 bp · LXL04_011514|LXL04_011514|OH1004|cDNA
ATGTCTCTTTCCAAAAGAGTATCGTTACCTCCTCAATCGCCGGCGCAACCTCAACAAGATCTCAAGCACCGTGTGATCACTTGCCTCAACAAGCTCTCTGACCGTGATACGCTTGCCGTTGCTGCCACGGAGCTGGAGTCTATCGCTCTCAGCCTCAATCATGACTCTTTTGCGCCTTTCCTTACTTACCTCTCGGCTACGTCGTCTTCCGACAAGTCCCCTGTACGGAGGCAATGCGTCCGTATCTTGGGGGTTCTATC...
CDS
下载 CDS FASTA1857 bp · LXL04_011514|LXL04_011514|OH1004|CDS
ATGTCTCTTTCCAAAAGAGTATCGTTACCTCCTCAATCGCCGGCGCAACCTCAACAAGATCTCAAGCACCGTGTGATCACTTGCCTCAACAAGCTCTCTGACCGTGATACGCTTGCCGTTGCTGCCACGGAGCTGGAGTCTATCGCTCTCAGCCTCAATCATGACTCTTTTGCGCCTTTCCTTACTTACCTCTCGGCTACGTCGTCTTCCGACAAGTCCCCTGTACGGAGGCAATGCGTCCGTATCTTGGGGGTTCTATC...
618 aa · LXL04_011514|LXL04_011514|OH1004|PROTEIN
MSLSKRVSLPPQSPAQPQQDLKHRVITCLNKLSDRDTLAVAATELESIALSLNHDSFAPFLTYLSATSSSDKSPVRRQCVRILGVLSVTHGDALSPHVSKMLAAVVRRLRDPDSAVRTACVGAVTSIASEISKPSFSSLSKPLVEAVMSEQDQNSQIGSAMCLSAAIEASPDPEPAQLQKLLPRVLKLIKSDSFKAKPALLTVIGSIAGAGGASFNRNSLNTLVPCLVDFLSSDDWAARKAAVEALGRLAVVEKVHLTDF...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_011514 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_011514 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:165945132-165947369 (-) |
| 描述 | Similar to TOR1L4: TORTIFOLIA1-like protein 4 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程 GO:0010031 circumnutation 生物过程 GO:0170002 halotropism 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005874 microtubule 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0010005 cortical microtubule, transverse to long axis 细胞组分 GO:0055028 cortical microtubule 细胞组分 GO:0008017 microtubule binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G27210 ath:AT1G50890 ath:AT2G07170 ath:AT4G27060 ath:AT5G62580 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.596
细胞核0.337
细胞膜0.163
高尔基体0.053
内质网0.050
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF24714.2TOR1L1_N19-292 aaPF23271.2HEAT_GCN134-153 aaPF25786.1HEAT_GCN1_C39-130 aaPF24987.2HEAT_EF3_N58-187 aaPF23271.2HEAT_GCN172-192 aaPF24492.2HEAT_ECM2972-145 aaPF13513.13HEAT_EZ74-125 aaPF02985.29HEAT223-250 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_011514 | PF24714.2 | TOR1L1_N | 19 | 292 | 2e-116 | 389.0 |
| LXL04_011514 | PF23271.2 | HEAT_GCN1 | 34 | 153 | 1.1e-14 | 55.6 |
| LXL04_011514 | PF25786.1 | HEAT_GCN1_C | 39 | 130 | 2.6e-07 | 31.5 |
| LXL04_011514 | PF24987.2 | HEAT_EF3_N | 58 | 187 | 1.5e-11 | 45.3 |
| LXL04_011514 | PF23271.2 | HEAT_GCN1 | 72 | 192 | 1.1e-14 | 55.6 |
| LXL04_011514 | PF24492.2 | HEAT_ECM29 | 72 | 145 | 1.7e-07 | 32.2 |
| LXL04_011514 | PF13513.13 | HEAT_EZ | 74 | 125 | 3.3e-14 | 53.7 |
| LXL04_011514 | PF02985.29 | HEAT | 223 | 250 | 2.5e-09 | 37.2 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q93ZH1 | 拟南芥 | TORTIFOLIA1-like protein 4 | 47.069% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q6NPR6 | 拟南芥 | TORTIFOLIA1-like protein 3 | 39.897% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9T041 | 拟南芥 | Microtubule-associated protein TORTIFOLIA1 | 32.671% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
F4IK92 | 拟南芥 | TORTIFOLIA1-like protein 2 | 31.261% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
F4I6M4 | 拟南芥 | TORTIFOLIA1-like protein 1 | 29.897% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |