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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_011494
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 165606945-165609565 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1107 bp · LXL04_011494|LXL04_011494|OH1004|cDNA

ATGGTGAAATTCGCTCTTCTACATGAAAATTTCCCGTCGTTTGAGTTTTCGGTTACAGCCCCGTTCGGCGAATCGACGAATCTCGCCGGATCTCTAGGTTCGGCGTCGATGGTGTTCCATGGCGTAGGTCTCCGCCGTGCTCTGGAGCTAGCATTTTGTATTGCTGGTATTTGGTCGGCGTATATATATCAAGGCGTTCTTCAAGAGACCGTGTCTACTAAGGGATTTGGCCCTGACAAGGAGAGGTTTGAACACTTGGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1107 bp · LXL04_011494|LXL04_011494|OH1004|CDS

ATGGTGAAATTCGCTCTTCTACATGAAAATTTCCCGTCGTTTGAGTTTTCGGTTACAGCCCCGTTCGGCGAATCGACGAATCTCGCCGGATCTCTAGGTTCGGCGTCGATGGTGTTCCATGGCGTAGGTCTCCGCCGTGCTCTGGAGCTAGCATTTTGTATTGCTGGTATTTGGTCGGCGTATATATATCAAGGCGTTCTTCAAGAGACCGTGTCTACTAAGGGATTTGGCCCTGACAAGGAGAGGTTTGAACACTTGGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

368 aa · LXL04_011494|LXL04_011494|OH1004|PROTEIN

MVKFALLHENFPSFEFSVTAPFGESTNLAGSLGSASMVFHGVGLRRALELAFCIAGIWSAYIYQGVLQETVSTKGFGPDKERFEHLAFLNLAQSAVCLQWSFIMIKLWGRGKGVRAPWWSYWSAGITNTIGPAMGIEALKYISYPAQVLAKSSKMIPVMLMGTLVYSIRYTFREYLCSLLVAGGVSIFALAKTNSKTINKLAHPNAPLGYGLCFLNLVFDGFTNATQDSISARYPKTNAWDMMLGMNLWGTVYNTVFMFG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_011494
TK1151 IDTkA03G593970
OH-1004 IDLXL04_011494
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 90.217
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_011494
位置Chr02:165606945-165609565 (-)
描述Similar to UTR3: UDP-galactose/UDP-glucose transporter 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g14360 将 UDP-葡萄糖从细胞质转运到高尔基体和内质网所需的必需糖转运蛋白。
The nucleotide sugar transporters AtUTr1 and AtUTr3 are required for the incorporation of UDP-glucose into the endoplasmic reticulum, are essential for pollen development and are needed for embryo sac progress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.04066.x
At2g02810 将 UDP-半乳糖和 UDP-葡萄糖从细胞质转运到高尔基体和内质网所需的必需糖转运蛋白，以确保蛋白质折叠的质量控制。
Transport of UDP-galactose in plants. Identification and functional characterization of AtUTr1, an Arabidopsis thaliana UDP-galactos/UDP-glucose transporter.2002 · DOI: 10.1074/jbc.m204081200
AtUTr1, a UDP-glucose/UDP-galactose transporter from Arabidopsis thaliana, is located in the endoplasmic reticulum and up-regulated by the unfolded protein response.2006 · DOI: 10.1074/jbc.m512210200
The nucleotide sugar transporters AtUTr1 and AtUTr3 are required for the incorporation of UDP-glucose into the endoplasmic reticulum, are essential for pollen development and are needed for embryo sac progress in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.04066.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011494 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0015780 nucleotide-sugar transmembrane transport 生物过程
GO:0030968 endoplasmic reticulum unfolded protein response 生物过程
GO:0072334 UDP-galactose transmembrane transport 生物过程
GO:0120112 UDP-glucose transmembrane transport into endoplasmic reticulum 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005459 UDP-galactose transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G14360
ath:AT2G02810
ddi:DDB_G0288927
ddi:DDB_G0288929
mmu:110172
yli:2912920
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.530
排名 1 · LXL04_011494 · OH-1004
高尔基体0.418
排名 2 · LXL04_011494 · OH-1004
细胞质0.060
排名 3 · LXL04_011494 · OH-1004
细胞核0.042
排名 4 · LXL04_011494 · OH-1004
细胞膜0.042
排名 5 · LXL04_011494 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08449.18UAA50-353 aa
PF00892.27EamA244-349 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_011494PF08449.18UAA503538.1e-75252.5
LXL04_011494PF00892.27EamA2443493.3e-0937.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M9S6拟南芥UDP-galactose/UDP-glucose transporter 380.303%Swiss-Prot强数据库同源证据
O64503拟南芥UDP-galactose/UDP-glucose transporter 177.879%Swiss-Prot强数据库同源证据

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