LXL04_011021 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_011021

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 156562049-156563445 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1086 bp · LXL04_011021|LXL04_011021|OH1004|cDNA

ATGAAAGGGAAGTTTGGGGCATCAGGGACTTATTTCCTGTTGAATACAGGCGCCAAGATTCCGGCCATAGGGCTCGGAACTTGGCAGAGCGGCGGCGACTTTTGTGTAGAGGCAGTAAAAACAGCTCTATCAGTCGGCTACCGCCACATCGATTGTGCACACCTGTACGGAAACGAGGCTGAAGTCGGTGAAGCGTTAACCGAATTTTTCAGGGGTTCTTCAAAAAGAGAGGATCTTTTTCTAACCTCCAAGCTATATTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1086 bp · LXL04_011021|LXL04_011021|OH1004|CDS

ATGAAAGGGAAGTTTGGGGCATCAGGGACTTATTTCCTGTTGAATACAGGCGCCAAGATTCCGGCCATAGGGCTCGGAACTTGGCAGAGCGGCGGCGACTTTTGTGTAGAGGCAGTAAAAACAGCTCTATCAGTCGGCTACCGCCACATCGATTGTGCACACCTGTACGGAAACGAGGCTGAAGTCGGTGAAGCGTTAACCGAATTTTTCAGGGGTTCTTCAAAAAGAGAGGATCTTTTTCTAACCTCCAAGCTATATTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

361 aa · LXL04_011021|LXL04_011021|OH1004|PROTEIN

MKGKFGASGTYFLLNTGAKIPAIGLGTWQSGGDFCVEAVKTALSVGYRHIDCAHLYGNEAEVGEALTEFFRGSSKREDLFLTSKLYCTMNSTNKIENSVKVSLKNLGVSYLDLYLMHWPESSAFGDATDPPASSGSEYRQFLSKLKTAWKTMEKLVDLGLVRAIGVSNFNIQQMKELLKFAKITPAVNQVELHPFWRQDELVKFCQSKHIHVSAHTPLGVPTSAPKPSESGSSEEDEPGTPRISFRRSRSVHGPMLKLSV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_011021`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_011021

位置 Chr02:156562049-156563445 (+)

描述 Similar to AKR4C9: NADPH-dependent aldo-keto reductase, chloroplastic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g37770`	氧化还原酶作用于广泛的底物：还原酮类固醇、芳香醛、酮、糖和其他脂肪醛，并氧化羟基类固醇。	Characterization of two novel aldo-keto reductases from Arabidopsis: expression patterns, broad substrate specificity, and an open active-site structure suggest a role in toxicant metabolism following stress.2009 · DOI: 10.1016/j.jmb.2009.07.023 NADPH-dependent reductases involved in the detoxification of reactive carbonyls in plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.202226
`At2g37790`	可能作用于酮类固醇、醛、酮和糖等多种底物的氧化还原酶。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011021 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009414 response to water deprivation 生物过程

GO:0009636 response to toxic substance 生物过程

GO:0009651 response to salt stress 生物过程

GO:0019640 D-glucuronate catabolic process to D-xylulose 5-phosphate 生物过程

GO:0019853 L-ascorbic acid biosynthetic process 生物过程

GO:0042593 glucose homeostasis 生物过程

GO:0042840 D-glucuronate catabolic process 生物过程

GO:0044597 daunorubicin metabolic process 生物过程

GO:0044598 doxorubicin metabolic process 生物过程

GO:0046185 aldehyde catabolic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G37770

ath:AT2G37790

bta:618607

dre:445326

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.542

排名 1 · LXL04_011021 · OH-1004

细胞核0.298

排名 2 · LXL04_011021 · OH-1004

质体0.107

排名 3 · LXL04_011021 · OH-1004

细胞膜0.083

排名 4 · LXL04_011021 · OH-1004

线粒体0.078

排名 5 · LXL04_011021 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00248.28Aldo_ket_red22-319 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_011021	`PF00248.28`	Aldo_ket_red	22	319	1.9e-58	198.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q0PGJ6`	拟南芥	NADPH-dependent aldo-keto reductase, chloroplastic	43.131%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q84TF0`	拟南芥	Aldo-keto reductase family 4 member C10	42.765%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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