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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_010646
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 150544607-150569291 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6156 bp · LXL04_010646|LXL04_010646|OH1004|cDNA

ATGTCGATAATTCTCGACGATAGTTTGAGACTTTTGGTTACTCTTACACTCATTTTGTCCACACTTGTGGTCTTTGAAGTAACCGTGGATGCTCTTCGTGAAATAGCAGAACAATTGGGTAAAAGGGATTGGAACTTTAGCCAAAATCCATGCGATGGAAACTCCAGTTGGGCAACGCTGCCTCGCATAGAAATGCCTCTTTATGTCAACATACTTAACTGTAGCTGCTCCTTTCCTGGCAATGTTTGTCACGTAGTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

6156 bp · LXL04_010646|LXL04_010646|OH1004|CDS

ATGTCGATAATTCTCGACGATAGTTTGAGACTTTTGGTTACTCTTACACTCATTTTGTCCACACTTGTGGTCTTTGAAGTAACCGTGGATGCTCTTCGTGAAATAGCAGAACAATTGGGTAAAAGGGATTGGAACTTTAGCCAAAATCCATGCGATGGAAACTCCAGTTGGGCAACGCTGCCTCGCATAGAAATGCCTCTTTATGTCAACATACTTAACTGTAGCTGCTCCTTTCCTGGCAATGTTTGTCACGTAGTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

2051 aa · LXL04_010646|LXL04_010646|OH1004|PROTEIN

MSIILDDSLRLLVTLTLILSTLVVFEVTVDALREIAEQLGKRDWNFSQNPCDGNSSWATLPRIEMPLYVNILNCSCSFPGNVCHVVSLSLKGQDLDGVLPPSLRKLTYIKNIDLSRNYLSGTIPPEWSSIRAINLSVMVNRLSGRIPTYLGDITSLVYLGLENNMFSGPVPAEIGKLTNLSVLVLSSNNLTGNLPQELNFLTNLVELQLSSNNFRGKIPDLGKCTKLEKLMIQASGLEGPIPESFSFLINLKELRISDLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_010646
TK1151 IDTkA03G539940
OH-1004 IDLXL04_010646
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)92.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.802 / OH-1004 46.465
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_010646
位置Chr02:150544607-150569291 (-)
描述Similar to At1g07650: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g07650
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07650 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g07650。 暂无已核实直接文献
At3g14840 可能的富含亮氨酸重复（LRR）受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g14840。 暂无已核实直接文献
At1g53440 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53440。 暂无已核实直接文献
At1g53430 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53430。 暂无已核实直接文献
At1g53420 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g53420。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010646 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0031667 response to nutrient levels 生物过程
GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07650
ath:AT1G53420
ath:AT1G53430
ath:AT1G53440
ath:AT3G14840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.317
排名 1 · LXL04_010646 · OH-1004
内质网0.228
排名 2 · LXL04_010646 · OH-1004
细胞质0.200
排名 3 · LXL04_010646 · OH-1004
溶酶体／液泡0.119
排名 4 · LXL04_010646 · OH-1004
细胞核0.097
排名 5 · LXL04_010646 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598.2LRR_14141-317 aa
PF12799.14LRR_4178-221 aa
PF13855.13LRR_8270-308 aa
PF12799.14LRR_4274-309 aa
PF11721.15Malectin363-539 aa
PF00069.32Pkinase617-885 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr619-887 aa
PF13976.12gag_pre-integrs1103-1163 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_010646PF23598.2LRR_141413171.6e-1247.6
LXL04_010646PF12799.14LRR_41782218.8e-1142.4
LXL04_010646PF13855.13LRR_82703088.8e-1348.5
LXL04_010646PF12799.14LRR_42743098.8e-1142.4
LXL04_010646PF11721.15Malectin3635393e-2693.1
LXL04_010646PF00069.32Pkinase6178851e-45156.9
LXL04_010646PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr6198872.6e-48165.3
LXL04_010646PF13976.12gag_pre-integrs110311631.9e-0937.9
LXL04_010646PF00665.33rve118212781.5e-1145.1
LXL04_010646PF29688.1TnsB_C124212921.3e-0629.0
LXL04_010646PF25597.2SH3_retrovirus135214141.4e-2073.6
LXL04_010646PF07727.20RVT_2156818108.6e-74248.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGE0拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0765048.691%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
C0LGN2拟南芥Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g1484048.623%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
C0LGG9拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5344048.069%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
C0LGG8拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5343048.339%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
C0LGG7拟南芥Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5342046.739%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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