基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_010565
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 149112622-149113919
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA603 bp · LXL04_010565|LXL04_010565|OH1004|cDNA
ATGGCGGACATTGAGTGCCCTACAGTGATGAACAACCTCATTACATTTCTTTCATCTCTTCTTCAACGAGTAGCGGAATCGAATGATCTCAACCCTCGATTCCACCCGCAGAAGATCTCGGCTTTTCATGGTCTCACCAGGCCAACTATCTCGATCCAAAGCTATTTAGAGAGGATTTTTAAGTACGCTAATTGTAGTCCTTCGTGTTACGTTGTTGCATACGTTTATCTCGATCGGTTTACTCAGCAACAGCCTGCGCT...
CDS
下载 CDS FASTA603 bp · LXL04_010565|LXL04_010565|OH1004|CDS
ATGGCGGACATTGAGTGCCCTACAGTGATGAACAACCTCATTACATTTCTTTCATCTCTTCTTCAACGAGTAGCGGAATCGAATGATCTCAACCCTCGATTCCACCCGCAGAAGATCTCGGCTTTTCATGGTCTCACCAGGCCAACTATCTCGATCCAAAGCTATTTAGAGAGGATTTTTAAGTACGCTAATTGTAGTCCTTCGTGTTACGTTGTTGCATACGTTTATCTCGATCGGTTTACTCAGCAACAGCCTGCGCT...
200 aa · LXL04_010565|LXL04_010565|OH1004|PROTEIN
MADIECPTVMNNLITFLSSLLQRVAESNDLNPRFHPQKISAFHGLTRPTISIQSYLERIFKYANCSPSCYVVAYVYLDRFTQQQPALSITSFNVHRLLITGVMIAAKFMDDLYYNNAYYAKVGGISTTEMNFLEVDFLFGLGFQLNVNPTTFHTYCSYLQREMLLLQPPLDHHHLSSSTSLSTKLLHYEDDHQQQEVAAV
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_010565 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_010565 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:149112622-149113919 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to CYCU4-1: Cyclin-U4-1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0051301 cell division 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0019901 protein kinase binding 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G44740 ath:AT5G07450 ath:AT5G61650 dosa:Os05g0398000 dosa:Os10g0563900 osa:4338711 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.762
细胞质0.374
线粒体0.043
质体0.022
细胞膜0.020
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF08613.17Cyclin29-145 aaPF00134.29Cyclin_N52-146 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_010565 | PF08613.17 | Cyclin | 29 | 145 | 1.9e-43 | 149.1 |
| LXL04_010565 | PF00134.29 | Cyclin_N | 52 | 146 | 4.4e-11 | 43.3 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。