基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_010519
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 148202818-148206729
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1548 bp · LXL04_010519|LXL04_010519|OH1004|cDNA
ATGGCAAATGAAGGTATAACCCAAGAAAACTATCCCATCAAAACTATAGTAATACTAGTTCAAGAAAATCATTCATTTGATCAGATGCTAGGCTGGATGAAATCTCTTAACCCCGAAATCGACGGTGTCACCGGAGAAGAATCCAACCCAATATCCACCACTGATCCGGACTCGACCCGGATACATTATAGCAACGACTCCGGCTTCATCCAGCCTGACCCTGGCCACTCTTACCAAGAGGTTTATGAACAAATCTTTGG...
CDS
下载 CDS FASTA1548 bp · LXL04_010519|LXL04_010519|OH1004|CDS
ATGGCAAATGAAGGTATAACCCAAGAAAACTATCCCATCAAAACTATAGTAATACTAGTTCAAGAAAATCATTCATTTGATCAGATGCTAGGCTGGATGAAATCTCTTAACCCCGAAATCGACGGTGTCACCGGAGAAGAATCCAACCCAATATCCACCACTGATCCGGACTCGACCCGGATACATTATAGCAACGACTCCGGCTTCATCCAGCCTGACCCTGGCCACTCTTACCAAGAGGTTTATGAACAAATCTTTGG...
515 aa · LXL04_010519|LXL04_010519|OH1004|PROTEIN
MANEGITQENYPIKTIVILVQENHSFDQMLGWMKSLNPEIDGVTGEESNPISTTDPDSTRIHYSNDSGFIQPDPGHSYQEVYEQIFGVPWTEESSSSSSGISPTMEGFAQQAERKEVGLSKIVMSGFKPDDIPVYRDLVMEFAVCDRWFSSVPGETQPNRLYVHSATSNGAISNDTTRLIEGFPQKTIFESVEESGFSFGIYYQYPPSTLFYRNLRQVKYIDNFHQFDLSFKKDCEDGKLPNYVVIEQRYFDLQVLPGND...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_010519 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_010519 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:148202818-148206729 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to NPC4: Non-specific phospholipase C4 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006796 phosphate-containing compound metabolic process 生物过程 GO:0009247 glycolipid biosynthetic process 生物过程 GO:0009395 phospholipid catabolic process 生物过程 GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程 GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程 GO:0048229 gametophyte development 生物过程 GO:0048364 root development 生物过程 GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G07230 ath:AT2G26870 ath:AT3G03520 ath:AT3G03530 ath:AT3G03540 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.669
细胞核0.341
线粒体0.077
细胞膜0.073
过氧化物酶体0.070
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF04185.20Phosphoesterase13-379 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_010519 | PF04185.20 | Phosphoesterase | 13 | 379 | 4.3e-105 | 352.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SRQ7 | 拟南芥 | Non-specific phospholipase C4 | 63.048% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9SRQ6 | 拟南芥 | Non-specific phospholipase C3 | 60.742% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9S816 | 拟南芥 | Non-specific phospholipase C5 | 61.237% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
O81020 | 拟南芥 | Non-specific phospholipase C2 | 58.522% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q8L7Y9 | 拟南芥 | Non-specific phospholipase C1 | 58.740% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |