LXL04_010429 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_010429

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 146418142-146420076 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1194 bp · LXL04_010429|LXL04_010429|OH1004|cDNA

ATGCGGTTCTATTTATCCCGAGGTTCAGACTGGCACCTCGGCTTAAGAACATTTAATTCGGCGAAATCCAGAATAAAATCCTACCTCCAAATCGCAACAGATCATGGCCACCTTCTCACAACCAACCACATGGAAACTTCTACTCCAAGAACATACACAACCATGCCCGAAAAGATCCCAGAAGATCCACCAAAACCCGACACCATTTCCAACATGTTAATCGACTCATTTGGAAGACAACACACATACTTAAGAATCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1194 bp · LXL04_010429|LXL04_010429|OH1004|CDS

ATGCGGTTCTATTTATCCCGAGGTTCAGACTGGCACCTCGGCTTAAGAACATTTAATTCGGCGAAATCCAGAATAAAATCCTACCTCCAAATCGCAACAGATCATGGCCACCTTCTCACAACCAACCACATGGAAACTTCTACTCCAAGAACATACACAACCATGCCCGAAAAGATCCCAGAAGATCCACCAAAACCCGACACCATTTCCAACATGTTAATCGACTCATTTGGAAGACAACACACATACTTAAGAATCTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

397 aa · LXL04_010429|LXL04_010429|OH1004|PROTEIN

MRFYLSRGSDWHLGLRTFNSAKSRIKSYLQIATDHGHLLTTNHMETSTPRTYTTMPEKIPEDPPKPDTISNMLIDSFGRQHTYLRISLTERCNLRCQYCMPAEGVDLTPNPKIMSQSELVRLATLFVHSGVNKIRLTGGEPSIRKDIEEICSQLSNLKGLKTLAMTTNGLTLARKLPKLQECGLNLLNISLDTLVPAKFEFMTRRKGHERVIESIHKAVELGYNPVKVNCVVMRGFNDDEICDFVELTKEKPVNVRFIEF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_010429`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_010429

位置 Chr02:146418142-146420076 (+)

描述 Similar to CNX2: GTP 3',8-cyclase, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g31955`	催化 GTP 环化生成 (8S)-3',8-环-7,8-二氢鸟苷三磷酸。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006777 Mo-molybdopterin cofactor biosynthetic process 生物过程

GO:0032324 molybdopterin cofactor biosynthetic process 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0005525 GTP binding 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0051539 4 iron, 4 sulfur cluster binding 分子功能

GO:0061798 GTP 3',8'-cyclase activity 分子功能

GO:0061799 cyclic pyranopterin monophosphate synthase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G31955

bta:281917

ddi:DDB_G0285137

hsa:4337

mmu:56738

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.914

排名 1 · LXL04_010429 · OH-1004

细胞质0.060

排名 2 · LXL04_010429 · OH-1004

细胞核0.051

排名 3 · LXL04_010429 · OH-1004

质体0.031

排名 4 · LXL04_010429 · OH-1004

细胞膜0.016

排名 5 · LXL04_010429 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04055.28Radical_SAM86-247 aa

PF13353.12Fer4_1290-200 aa

PF06463.19Mob_synth_C254-378 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_010429	`PF04055.28`	Radical_SAM	86	247	3.3e-34	119.2
LXL04_010429	`PF13353.12`	Fer4_12	90	200	6.3e-06	27.3
LXL04_010429	`PF06463.19`	Mob_synth_C	254	378	5.1e-37	127.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39055`	拟南芥	GTP 3',8-cyclase	70.603%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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