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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_009569
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 129143304-129145739 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

633 bp · LXL04_009569|LXL04_009569|OH1004|cDNA

ATGGCCGCAAGTGCTTCAAGGTTCATCAAGTGTGTGACGGTTGGTGATGGCGCTGTTGGAAAGACTTGTATGCTAATTTGCTATACGAGCAACAAATTCCCAACCGACTATGTACCAACAGTATTTGACAACTTCAGTGCAAATGTTGTAGTTGAAAGCACCACCGTCAATTTAGGGCTTTGGGACACAGCCGGACAAGAAGATTACAACCGGTTAAGACCCTTGAGTTATCGAGGAGCCGATGTATTTGTTCTAGCCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

633 bp · LXL04_009569|LXL04_009569|OH1004|CDS

ATGGCCGCAAGTGCTTCAAGGTTCATCAAGTGTGTGACGGTTGGTGATGGCGCTGTTGGAAAGACTTGTATGCTAATTTGCTATACGAGCAACAAATTCCCAACCGACTATGTACCAACAGTATTTGACAACTTCAGTGCAAATGTTGTAGTTGAAAGCACCACCGTCAATTTAGGGCTTTGGGACACAGCCGGACAAGAAGATTACAACCGGTTAAGACCCTTGAGTTATCGAGGAGCCGATGTATTTGTTCTAGCCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

210 aa · LXL04_009569|LXL04_009569|OH1004|PROTEIN

MAASASRFIKCVTVGDGAVGKTCMLICYTSNKFPTDYVPTVFDNFSANVVVESTTVNLGLWDTAGQEDYNRLRPLSYRGADVFVLAFSLVSRASYENVLKKWIPELQHFAPGVPVVLAGTKLDLREDKRYLADHPGLVPVTTAQGEELRKQMGAAYYIECSSKTQQNVKSVFDAAIRVVIKPQQAPKEKKKPRPGCFVNMFCNKKLTCLG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_009569
TK1151 IDTkA03G449150
OH-1004 IDLXL04_009569
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_009569
位置Chr02:129143304-129145739 (+)
描述Similar to RAC3: Rac-like GTP-binding protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g48040 作为脱落酸 反应的负调节剂。
Plasma membrane-associated ROP10 small GTPase is a specific negative regulator of abscisic acid responses in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1105/tpc.005611
At5g62880 与 ICR5 和 KIN13A 相关时参与皮质微管的局部分解。
CORTICAL MICROTUBULE DISORDERING1 Is Required for Secondary Cell Wall Patterning in Xylem Vessels.2017 · DOI: 10.1105/tpc.17.00663

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0742200 非活性 GDP 结合 Rho GTP 酶驻留在细胞质中，存在于与 Rho GDP 解离抑制剂 (Rho GDI) 的复合物中，并从 GDI 蛋白中释放出来，以便在激活后易位到膜上。 暂无已核实直接文献
Os06g0234200 非活性 GDP 结合 Rho GTP 酶驻留在细胞质中，存在于与 Rho GDP 解离抑制剂 (Rho GDI) 的复合物中，并从 GDI 蛋白中释放出来，以便在激活后易位到膜上。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009569 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007015 actin filament organization 生物过程
GO:0007163 establishment or maintenance of cell polarity 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0007264 small GTPase-mediated signal transduction 生物过程
GO:0008360 regulation of cell shape 生物过程
GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0030865 cortical cytoskeleton organization 生物过程
GO:0032956 regulation of actin cytoskeleton organization 生物过程
GO:2001009 regulation of plant-type cell wall cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G48040
ath:AT5G62880
dosa:Os02g0742200
dosa:Os06g0234200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.649
排名 1 · LXL04_009569 · OH-1004
细胞质0.344
排名 2 · LXL04_009569 · OH-1004
细胞核0.120
排名 3 · LXL04_009569 · OH-1004
高尔基体0.090
排名 4 · LXL04_009569 · OH-1004
内质网0.056
排名 5 · LXL04_009569 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00071.29Ras10-179 aa
PF08477.20Roc10-123 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_009569PF00071.29Ras101793.6e-48163.9
LXL04_009569PF08477.20Roc101234.7e-2279.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SU67拟南芥Rac-like GTP-binding protein ARAC883.092%Swiss-Prot强数据库同源证据
O82481拟南芥Rac-like GTP-binding protein ARAC1081.221%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q6Z808水稻Rac-like GTP-binding protein 383.962%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q67VP4水稻Rac-like GTP-binding protein 490.659%Swiss-Prot强数据库同源证据

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