基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_009309
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 122410567-122412604
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA969 bp · LXL04_009309|LXL04_009309|OH1004|cDNA
ATGGCAGCTTTTTCGTACCAACAACACCAATCTCTACTCCTTGATCAGAGTGTTTTCTTTCCATACCataccaccaccaccaccaccaccaccgccacctcTTTCTCTGATCAGTTCCACCAACACCACCATGATCAAGTTTCTGAATCAAACCAGTTGCAGAGCCCAGGCTCTTCAATGTCAATGGTTCTTGATGATCAGAAAATTTCGAGTGGGAATGAGTTGTTGGCCAAGAAAAGGAAGGACAAACAAATGTGTTC...
CDS
下载 CDS FASTA969 bp · LXL04_009309|LXL04_009309|OH1004|CDS
ATGGCAGCTTTTTCGTACCAACAACACCAATCTCTACTCCTTGATCAGAGTGTTTTCTTTCCATACCATACCACCACCACCACCACCACCACCGCCACCTCTTTCTCTGATCAGTTCCACCAACACCACCATGATCAAGTTTCTGAATCAAACCAGTTGCAGAGCCCAGGCTCTTCAATGTCAATGGTTCTTGATGATCAGAAAATTTCGAGTGGGAATGAGTTGTTGGCCAAGAAAAGGAAGGACAAACAAATGTGTTC...
322 aa · LXL04_009309|LXL04_009309|OH1004|PROTEIN
MAAFSYQQHQSLLLDQSVFFPYHTTTTTTTTATSFSDQFHQHHHDQVSESNQLQSPGSSMSMVLDDQKISSGNELLAKKRKDKQMCSVNHAQSKDTSTKIKKQKKSNDYQEEKRKKNITKQSSCDEEGAIGYIHVRARRGQATDSHSLAERVRREKISERMKLLQAIVPGCDKVTGKALMLDEIINYVQSLQNQVEFLSMKLASVNPMLYDFGVDLDTFMLKPDENMSSMVLPIMPIPSVQQCSTNGVATVAATFAPATD...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_009309 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_009309 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:122410567-122412604 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to BHLH137: Transcription factor bHLH137 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0009739 response to gibberellin 生物过程 GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010372 positive regulation of gibberellin biosynthetic process 生物过程 GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程 GO:0042127 regulation of cell population proliferation 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0051510 regulation of unidimensional cell growth 生物过程 GO:0051511 negative regulation of unidimensional cell growth 生物过程 GO:0071368 cellular response to cytokinin stimulus 生物过程 GO:2000024 regulation of leaf development 生物过程 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G07340 ath:AT5G50915 dosa:Os08g0536800 dosa:Os09g0510500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.976
细胞质0.093
细胞膜0.026
内质网0.018
质体0.011
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00010.32HLH145-192 aaPF23173.3bHLH_SAC51150-194 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_009309 | PF00010.32 | HLH | 145 | 192 | 8.5e-07 | 29.4 |
| LXL04_009309 | PF23173.3 | bHLH_SAC51 | 150 | 194 | 2.6e-08 | 34.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q93W88 | 拟南芥 | Transcription factor bHLH137 | 45.520% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SRT2 | 拟南芥 | Transcription factor bHLH62 | 62.857% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q0J0G7 | 水稻 | Transcription factor BC1 | 56.627% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
A3BV95 | 水稻 | Basic helix-loop-helix protein 80 | 52.941% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
A2YXI4 | 水稻 | Basic helix-loop-helix protein 80 | 52.941% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |