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基因概览

LXL04_008746

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 107874756-107879938 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

876 bp · LXL04_008746|LXL04_008746|OH1004|cDNA

ATGCAGAGCTTAGCTAAAAGGCAACGCGGGGTTCGTCAATGCTCTCGATTTTTCCTCGATGAATTCAAACGAAGAACGACAAGCCTTAGCAGTAGCAGCAACAGCTCTCTCCTCGATCATTCGCTCACCTGTGATCCTGATTCTGTTGTATTAGTGGAAGGCAATGCGAGTTCGAGAACCGTAGTTCTCAACAGACCTTCCTTTCTCAATGCGCTCAACACTGCCATGGGACCTGGAGGACAACTAAAACTTGCAGATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

876 bp · LXL04_008746|LXL04_008746|OH1004|CDS

ATGCAGAGCTTAGCTAAAAGGCAACGCGGGGTTCGTCAATGCTCTCGATTTTTCCTCGATGAATTCAAACGAAGAACGACAAGCCTTAGCAGTAGCAGCAACAGCTCTCTCCTCGATCATTCGCTCACCTGTGATCCTGATTCTGTTGTATTAGTGGAAGGCAATGCGAGTTCGAGAACCGTAGTTCTCAACAGACCTTCCTTTCTCAATGCGCTCAACACTGCCATGGGACCTGGAGGACAACTAAAACTTGCAGATTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

291 aa · LXL04_008746|LXL04_008746|OH1004|PROTEIN

MQSLAKRQRGVRQCSRFFLDEFKRRTTSLSSSSNSSLLDHSLTCDPDSVVLVEGNASSRTVVLNRPSFLNALNTAMGPGGQLKLADFGLARIFGCPDRRFTHQGNSDIDQLGKIFAGTRGIKKVTFSMAAALYAHCCCLRFWTILLLYSRCSKEDCCSIFSLNWGYYGNSDICVISNGNFEDKICDEKRDWIHSKKDGVLKIGGDFKILNFFRTRGHFWHTFDVWQPGVCIEFWHLKASRVINCIIFWKICYKNCGFLKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_008746`
TK1151 ID	TkA03G338620
OH-1004 ID	LXL04_008746
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	94.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 77.273 / OH-1004 29.210 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_008746

位置 Chr02:107874756-107879938 (-)

描述 Similar to CDKD-1: Cyclin-dependent kinase D-1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g73690`	细胞周期蛋白dependent kinase D-1。	暂无已核实直接文献
`At1g18040`	可能与细胞周期蛋白CYCH1-1形成稳定复合物，磷酸化人类CDK2及RNA聚合酶II大亚基的C端结构域(CTD)。	暂无已核实直接文献
`At1g66750`	与细胞周期蛋白 CYCH1-1 形成稳定复合物，可磷酸化人类 CDK2 及 RNA 聚合酶 II 大亚基的 C 端结构域 (CTD)。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0392300`	CDK 激活激酶，可能控制 G1/S 期进程。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2Y4B6`	细胞周期蛋白dependent kinase D-1。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008746 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程

GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程

GO:0051301 cell division 生物过程

GO:0051726 regulation of cell cycle 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0070985 transcription factor TFIIK complex 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G18040

ath:AT1G66750

ath:AT1G73690

dosa:Os05g0392300

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.330

排名 1 · LXL04_008746 · OH-1004

细胞核0.314

排名 2 · LXL04_008746 · OH-1004

线粒体0.204

排名 3 · LXL04_008746 · OH-1004

细胞膜0.101

排名 4 · LXL04_008746 · OH-1004

内质网0.086

排名 5 · LXL04_008746 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C9U2`	拟南芥	Cyclin-dependent kinase D-1	41.379%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9LMT0`	拟南芥	Cyclin-dependent kinase D-3	40.230%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9C9M7`	拟南芥	Cyclin-dependent kinase D-2	70.968%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`P29620`	水稻	Cyclin-dependent kinase D-1	40.230%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`A2Y4B6`	水稻	Cyclin-dependent kinase D-1	40.230%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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