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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_008664
当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 105499972-105502527 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2556 bp · LXL04_008664|LXL04_008664|OH1004|cDNA

ATGGGAGGAATACACAAGTTACCGGCATCCTCGCTCGCCTTACTATTCATCATCTCTTACTTTCTGTCTACCATTAATGCCCGATTCACTCCTTCAGACAACTACCTCATCGACTGTGGATCACCTCAAAACACCATTCTTGACGACGGCCGGACGTTTAAATCAGACCCTCAATCGGTCTCCTTCCTCTCCACCGACGAAAACATATTTGCCACCTCAGATTCCATCCCGGAAAACGAAAAGCTTCATCTGTACCGAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2556 bp · LXL04_008664|LXL04_008664|OH1004|CDS

ATGGGAGGAATACACAAGTTACCGGCATCCTCGCTCGCCTTACTATTCATCATCTCTTACTTTCTGTCTACCATTAATGCCCGATTCACTCCTTCAGACAACTACCTCATCGACTGTGGATCACCTCAAAACACCATTCTTGACGACGGCCGGACGTTTAAATCAGACCCTCAATCGGTCTCCTTCCTCTCCACCGACGAAAACATATTTGCCACCTCAGATTCCATCCCGGAAAACGAAAAGCTTCATCTGTACCGAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

851 aa · LXL04_008664|LXL04_008664|OH1004|PROTEIN

MGGIHKLPASSLALLFIISYFLSTINARFTPSDNYLIDCGSPQNTILDDGRTFKSDPQSVSFLSTDENIFATSDSIPENEKLHLYRTARIFDSESVYKFLVFQPGRHFLRLYFYPLHHPSYNLTTAVFTVKTDNLVFLHDFSAREKTASHFKEYLVNVTSDDFSLVFSPLKKSFAFVNGIEFVSAPDELVPNSATVVSPPGVFNGISDYDFQVLHRINVGGPMVSPKNDTLSRTWMSDSHGYMMFPKGDKLVSVDPSTIT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_008664
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_008664
位置Chr02:105499972-105502527 (+)
描述Similar to At5g61350: Probable receptor-like protein kinase At5g61350
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61350 可能的受体样蛋白激酶 At5g61350。 暂无已核实直接文献
At4g39110 可能的受体样蛋白激酶 At4g39110。 暂无已核实直接文献
At2g21480 可能的受体样蛋白激酶At2g21480。 暂无已核实直接文献
At5g54380 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
A receptor-like kinase mediates the response of Arabidopsis cells to the inhibition of cellulose synthesis.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.018
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008664 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010483 pollen tube reception 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051924 regulation of calcium ion transport 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0080147 root hair cell development 生物过程
GO:0097275 intracellular ammonium homeostasis 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21480
ath:AT3G46290
ath:AT4G39110
ath:AT5G54380
ath:AT5G61350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.755
排名 1 · LXL04_008664 · OH-1004
内质网0.103
排名 2 · LXL04_008664 · OH-1004
细胞质0.085
排名 3 · LXL04_008664 · OH-1004
溶酶体／液泡0.077
排名 4 · LXL04_008664 · OH-1004
细胞核0.051
排名 5 · LXL04_008664 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11721.15Malectin35-161 aa
PF12819.14Malectin_like37-392 aa
PF11721.15Malectin295-363 aa
PF00069.32Pkinase510-723 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr512-706 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_008664PF11721.15Malectin351611.2e-1352.1
LXL04_008664PF12819.14Malectin_like373927e-2898.6
LXL04_008664PF11721.15Malectin2953631.2e-1352.1
LXL04_008664PF00069.32Pkinase5107235e-41141.6
LXL04_008664PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr5127063.4e-45155.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLJ8拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g6135062.125%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9T020拟南芥Probable receptor-like protein kinase At4g3911052.014%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SJT0拟南芥Probable receptor-like protein kinase At2g2148054.113%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LK35拟南芥Receptor-like protein kinase THESEUS 152.941%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 149.825%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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