基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_008663
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 105470775-105472136
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1362 bp · LXL04_008663|LXL04_008663|OH1004|cDNA
ATGGGTCAAGATGGTTTCACTGCTCAAAAGCGAGGCTCTTCCACGCTACCCACTTCCACCGCCCCAAACGGTGGCTCCCGGAGCAGCCGATCTCTCCTCCGCGGTGGCGGCGGAAACCGTCAGATCCATAAAACGCTTAACAACATCAAGATCACAATCCTCTGTGGTTTAGTTACAATTCTTGTTCTTCGTGGTACGATAGGTTTCGGGTCCCTCTCTTCCGACAATGACCTAGAGAACCAAGCGATTATTGAAGAAAC...
CDS
下载 CDS FASTA1362 bp · LXL04_008663|LXL04_008663|OH1004|CDS
ATGGGTCAAGATGGTTTCACTGCTCAAAAGCGAGGCTCTTCCACGCTACCCACTTCCACCGCCCCAAACGGTGGCTCCCGGAGCAGCCGATCTCTCCTCCGCGGTGGCGGCGGAAACCGTCAGATCCATAAAACGCTTAACAACATCAAGATCACAATCCTCTGTGGTTTAGTTACAATTCTTGTTCTTCGTGGTACGATAGGTTTCGGGTCCCTCTCTTCCGACAATGACCTAGAGAACCAAGCGATTATTGAAGAAAC...
453 aa · LXL04_008663|LXL04_008663|OH1004|PROTEIN
MGQDGFTAQKRGSSTLPTSTAPNGGSRSSRSLLRGGGGNRQIHKTLNNIKITILCGLVTILVLRGTIGFGSLSSDNDLENQAIIEETNRILAEIRSDKDPDDPEENLDQTTINLNDTYSLGAKISNWDEERSLWLSRNQDFPNIVNGKARILLVTGSPPSPCDNAIGDHYLLKSIKNKIDYCRIHGIEIVYNMAHLDKELAGYWAKLPLIRRLMLSHPEVEWIWWMDSDALFTDMVFEIPLSKYKDHNMVIHGYPDLLFN...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_008663 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_008663 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:105470775-105472136 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to XXT3: Probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 3 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009969 xyloglucan biosynthetic process 生物过程 GO:0010411 xyloglucan metabolic process 生物过程 GO:0048767 root hair elongation 生物过程 GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005768 endosome 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分 GO:0016758 hexosyltransferase activity 分子功能 GO:0033843 xyloglucan 6-xylosyltransferase activity 分子功能 GO:0035252 UDP-xylosyltransferase activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G18690 ath:AT1G74380 ath:AT5G07720 dosa:Os02g0529600 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.778
内质网0.155
细胞质0.085
细胞膜0.044
细胞核0.035
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF05637.19Glyco_transf_34148-385 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_008663 | PF05637.19 | Glyco_transf_34 | 148 | 385 | 1e-61 | 209.4 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LF80 | 拟南芥 | Probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 3 | 76.652% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9CA75 | 拟南芥 | Probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 5 | 75.219% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9M9U0 | 拟南芥 | Xyloglucan 6-xylosyltransferase 4 | 63.710% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q6H765 | 水稻 | Probable glycosyltransferase 2 | 68.037% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
B8AIZ4 | 水稻 | Probable glycosyltransferase 2 | 68.037% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |