基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_008530
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 101900779-101908001
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4305 bp · LXL04_008530|LXL04_008530|OH1004|cDNA
ATGGATGGGAGTGACATATACAAAGCGGCAAATAGTATAAGGTTAGGGAGTTTAAGAGCAGGGAGTACACGAGCTCCAAGTTTAAGATCTGGAAGTACTTCAGTATGGAGAAATTCCGGCATGGATGTTTTCTCAAAATCTTCTCGCGAAGACGACGATGAAGAAGCTCTTAAATGGGCCTCCCTTGAAAAGCTACCAACTTTCGATCGTTTAAAGAAAGGTTTACTTTTCGGATCAACCGGACCATCTAACGAAGTTGA...
CDS
下载 CDS FASTA4305 bp · LXL04_008530|LXL04_008530|OH1004|CDS
ATGGATGGGAGTGACATATACAAAGCGGCAAATAGTATAAGGTTAGGGAGTTTAAGAGCAGGGAGTACACGAGCTCCAAGTTTAAGATCTGGAAGTACTTCAGTATGGAGAAATTCCGGCATGGATGTTTTCTCAAAATCTTCTCGCGAAGACGACGATGAAGAAGCTCTTAAATGGGCCTCCCTTGAAAAGCTACCAACTTTCGATCGTTTAAAGAAAGGTTTACTTTTCGGATCAACCGGACCATCTAACGAAGTTGA...
1434 aa · LXL04_008530|LXL04_008530|OH1004|PROTEIN
MDGSDIYKAANSIRLGSLRAGSTRAPSLRSGSTSVWRNSGMDVFSKSSREDDDEEALKWASLEKLPTFDRLKKGLLFGSTGPSNEVDVDNLGVEDRKHLLDRLVKTADEDNEKFLLKLRARLDRVGIDLPTIEVRYDHVTVEADINTGSRALPSFINFHIDFFEGLLTRLNLLPNSKKHITILNDVSGCIKPSRMTLLLGPPSSGKTTLLLALAGALDKGLKSSGKVTYNGHELHEFVPERTSAYISQNDVHIGEMTVRE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_008530 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_008530 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:101900779-101908001 (-) | ||||||
| 描述 | Similar to PDR1: Pleiotropic drug resistance protein 1 | ||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程 GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程 GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0009914 hormone transport 生物过程 GO:0010193 response to ozone 生物过程 | ||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G15520 nta:107799533 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.702
内质网0.158
细胞质0.105
溶酶体／液泡0.088
高尔基体0.064
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14510.12ABC_trans_N107-158 aaPF00005.34ABC_tran183-365 aaPF19055.7ABC2_membrane_7398-451 aaPF01061.30ABC2_membrane519-731 aaPF08370.17PDR_assoc736-795 aaPF00005.34ABC_tran863-1015 aaPF19055.7ABC2_membrane_71044-1105 aaPF01061.30ABC2_membrane1161-1374 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_008530 | PF14510.12 | ABC_trans_N | 107 | 158 | 5.5e-06 | 27.4 |
| LXL04_008530 | PF00005.34 | ABC_tran | 183 | 365 | 6.1e-42 | 144.2 |
| LXL04_008530 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 398 | 451 | 2.8e-12 | 46.9 |
| LXL04_008530 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 519 | 731 | 1.3e-113 | 378.5 |
| LXL04_008530 | PF08370.17 | PDR_assoc | 736 | 795 | 5.8e-20 | 71.5 |
| LXL04_008530 | PF00005.34 | ABC_tran | 863 | 1015 | 6.1e-42 | 144.2 |
| LXL04_008530 | PF19055.7 | ABC2_membrane_7 | 1044 | 1105 | 2.8e-12 | 46.9 |
| LXL04_008530 | PF01061.30 | ABC2_membrane | 1161 | 1374 | 1.3e-113 | 378.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M9E1 | 拟南芥 | ABC transporter G family member 40 | 68.542% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |