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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005432
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 163821548-163822120 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

573 bp · LXL04_005432|LXL04_005432|OH1004|cDNA

ATGACACTTCCACTTGGGAAAGCAAACTTAAACCTCAAAGGCTATCAATTCAATATGAAgttcttctctcttcttctcatATTTCTCTTTCTTGGCCTCTTTGAAGCTCCATTAATGGTGATGGGAGATAGAAAGCTGATAGAAAGCACGTGCAAGGCCACACCTTCATACAATCTttgtctctcaactctcttaTCAAACCCCAAAAGTTTAAGTGGTGATGTTAGTGACTTGGGACTAATCATGGTGGGTGCAACTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

573 bp · LXL04_005432|LXL04_005432|OH1004|CDS

ATGACACTTCCACTTGGGAAAGCAAACTTAAACCTCAAAGGCTATCAATTCAATATGAAGTTCTTCTCTCTTCTTCTCATATTTCTCTTTCTTGGCCTCTTTGAAGCTCCATTAATGGTGATGGGAGATAGAAAGCTGATAGAAAGCACGTGCAAGGCCACACCTTCATACAATCTTTGTCTCTCAACTCTCTTATCAAACCCCAAAAGTTTAAGTGGTGATGTTAGTGACTTGGGACTAATCATGGTGGGTGCAACTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

190 aa · LXL04_005432|LXL04_005432|OH1004|PROTEIN

MTLPLGKANLNLKGYQFNMKFFSLLLIFLFLGLFEAPLMVMGDRKLIESTCKATPSYNLCLSTLLSNPKSLSGDVSDLGLIMVGATRIKATQAVQHIKSLYRSHPELRRPLNECAQMYLAVVKADVPSAIQALDGGQPKFAEDGMADTAVEAQACERSFSDGGHKSPVTEMNKGVENIANVARAIIRMLL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005432
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005432
位置Chr01:163821548-163822120 (-)
描述Similar to C/VIF1: Cell wall / vacuolar inhibitor of fructosidase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g47960 抑制液泡中的果糖酶（液泡内转酶VI）。
In Arabidopsis thaliana, the invertase inhibitors AtC/VIF1 and 2 exhibit distinct target enzyme specificities and expression profiles.2004 · DOI: 10.1016/j.febslet.2004.07.062
At5g64620 抑制细胞壁和液泡中的果糖苷酶。
In Arabidopsis thaliana, the invertase inhibitors AtC/VIF1 and 2 exhibit distinct target enzyme specificities and expression profiles.2004 · DOI: 10.1016/j.febslet.2004.07.062
At3g17220 抑制花、长角果和花粉管中的果胶甲酯酶（PME）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005432 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0043086 negative regulation of catalytic activity 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0012505 endomembrane system 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分
GO:0004857 enzyme inhibitor activity 分子功能
GO:0046910 pectinesterase inhibitor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G47960
ath:AT3G17220
ath:AT5G64620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.449
排名 1 · LXL04_005432 · OH-1004
溶酶体／液泡0.186
排名 2 · LXL04_005432 · OH-1004
内质网0.142
排名 3 · LXL04_005432 · OH-1004
细胞质0.121
排名 4 · LXL04_005432 · OH-1004
细胞膜0.107
排名 5 · LXL04_005432 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04043.21PMEI45-185 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005432PF04043.21PMEI451852.9e-1867.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4HWQ8拟南芥Cell wall / vacuolar inhibitor of fructosidase 145.000%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O49603拟南芥Cell wall / vacuolar inhibitor of fructosidase 231.200%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9LUV1拟南芥Pectinesterase inhibitor 224.691%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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