基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_003446
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 79453996-79475237
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4650 bp · LXL04_003446|LXL04_003446|OH1004|cDNA
ATGGTCATCTTGCATAGCTTTCAGCCATGGATATCCCCAAGAATTCAAAATATCTCAAGGATTTCTCGTCCGAAGAGAGGATCAAGCCCAGACCCATGTACTTGGATCCATTCTTCAGCTTTATCTGTAAATGGCATGTTCAAGAACCATCAAGGGAAGCGAGAAGTCATAATAATAAATGCATCACATAAGACGGGTATCTCAATGAAAAATACTAAGTTGAAGGTGAAATTACCAGATTACCCTCAGATGGATCAAAA...
CDS
下载 CDS FASTA4650 bp · LXL04_003446|LXL04_003446|OH1004|CDS
ATGGTCATCTTGCATAGCTTTCAGCCATGGATATCCCCAAGAATTCAAAATATCTCAAGGATTTCTCGTCCGAAGAGAGGATCAAGCCCAGACCCATGTACTTGGATCCATTCTTCAGCTTTATCTGTAAATGGCATGTTCAAGAACCATCAAGGGAAGCGAGAAGTCATAATAATAAATGCATCACATAAGACGGGTATCTCAATGAAAAATACTAAGTTGAAGGTGAAATTACCAGATTACCCTCAGATGGATCAAAA...
1549 aa · LXL04_003446|LXL04_003446|OH1004|PROTEIN
MVILHSFQPWISPRIQNISRISRPKRGSSPDPCTWIHSSALSVNGMFKNHQGKREVIIINASHKTGISMKNTKLKVKLPDYPQMDQKRIMIISALASCLLVKLLQQNHGKTVISAVKYLLSRAIQSFSTTSLPFACISNSLDKPTPLQLDVSLPSLYDIKWGFSRIMYLFNIQLERNVSTFLIVLLLACFSFVLIGGTLFYKYRRNTQSFEDCLWEAWACLCSSSTHLKQRTRVERVIGFVLAIWGILFYSRLLGTMTEQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_003446 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_003446 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:79453996-79475237 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At5g43745: Putative ion channel POLLUX-like 2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006813 potassium ion transport 生物过程 GO:0034220 monoatomic ion transmembrane transport 生物过程 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0009536 plastid 细胞组分 GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分 GO:0031965 nuclear membrane 细胞组分 GO:0042170 plastid membrane 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT5G02940 ath:AT5G43745 dosa:Os03g0843600 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.307
细胞核0.291
细胞质0.259
内质网0.128
高尔基体0.074
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF06241.18Castor_Poll_mid428-521 aaPF06241.18Castor_Poll_mid742-839 aaPF00646.39F-box1026-1065 aaPF24758.2LRR_At5g563701123-1235 aaPF08387.16FBD1392-1433 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_003446 | PF06241.18 | Castor_Poll_mid | 428 | 521 | 4.8e-48 | 162.2 |
| LXL04_003446 | PF06241.18 | Castor_Poll_mid | 742 | 839 | 4.8e-48 | 162.2 |
| LXL04_003446 | PF00646.39 | F-box | 1026 | 1065 | 7.7e-09 | 35.8 |
| LXL04_003446 | PF24758.2 | LRR_At5g56370 | 1123 | 1235 | 1.9e-12 | 48.1 |
| LXL04_003446 | PF08387.16 | FBD | 1392 | 1433 | 2.8e-06 | 27.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。