LXL04_002245 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_002245

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 44541278-44542907 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1143 bp · LXL04_002245|LXL04_002245|OH1004|cDNA

ATGGACCAGCAGCGAAAGAGCTTTTGCACAATGGCGGATGCGTATGGAGTTATCTTAGACTCTCCGAGCCTCCATAAGAACCTCGACGTTGTGCTCTTGGGTCATCATCACGCTAAGGATGATTGCTTTCAGTTTGATTTTAAGCTTCCCGACATTCGACGACCAATCTCTAATTTTGTAAAGACAAGAGAAGCAGGGGAATTTCTCAGTGGTGCTTTAGCTGGAGCCATGACCAAAGCTGTTCTTGCTCCTCTCGAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1143 bp · LXL04_002245|LXL04_002245|OH1004|CDS

ATGGACCAGCAGCGAAAGAGCTTTTGCACAATGGCGGATGCGTATGGAGTTATCTTAGACTCTCCGAGCCTCCATAAGAACCTCGACGTTGTGCTCTTGGGTCATCATCACGCTAAGGATGATTGCTTTCAGTTTGATTTTAAGCTTCCCGACATTCGACGACCAATCTCTAATTTTGTAAAGACAAGAGAAGCAGGGGAATTTCTCAGTGGTGCTTTAGCTGGAGCCATGACCAAAGCTGTTCTTGCTCCTCTCGAAAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

380 aa · LXL04_002245|LXL04_002245|OH1004|PROTEIN

MDQQRKSFCTMADAYGVILDSPSLHKNLDVVLLGHHHAKDDCFQFDFKLPDIRRPISNFVKTREAGEFLSGALAGAMTKAVLAPLETIRTRMVVGVGSKTISGSFLQVIEKQGWQGLWAGNAINMIRIVPTQAIELGTFECVKRVMTSAKEKFSKEDPSIQIGQVNLSFPLSWLSPVALGGAAAGFVSTLVCHPLEVLKVITVSRQNSAVNRAQYTANDRLTVSPDTYPNLSIAVSKIYKSGGIGSFYAGLSPTLIGMLP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_002245`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_002245

位置 Chr01:44541278-44542907 (-)

描述 Similar to At3g20240: Probable mitochondrial adenine nucleotide transporter BTL1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g20240`	可能是线粒体腺苷酸载体，催化 ATP、ADP 和 AMP 的转运。	暂无已核实直接文献
`At4g32400`	可能的线粒体腺苷酸载体，可催化 ATP、ADP 和 AMP 的转运，但不催化 ADP-葡萄糖的转运。	Isolation and characterization of shs1, a sugar-hypersensitive and ABA-insensitive mutant with multiple stress responses.2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9219-y

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002245 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0015866 ADP transport 生物过程

GO:0015867 ATP transport 生物过程

GO:0035349 coenzyme A transmembrane transport 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0080121 AMP transport 生物过程

GO:0090480 purine nucleotide-sugar transmembrane transport 生物过程

GO:1990559 mitochondrial coenzyme A transmembrane transport 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009536 plastid 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G20240

ath:AT4G32400

xtr:780169

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.892

排名 1 · LXL04_002245 · OH-1004

细胞质0.045

排名 2 · LXL04_002245 · OH-1004

质体0.032

排名 3 · LXL04_002245 · OH-1004

细胞核0.030

排名 4 · LXL04_002245 · OH-1004

细胞膜0.026

排名 5 · LXL04_002245 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00153.33Mito_carr67-148 aa

PF00153.33Mito_carr178-277 aa

PF00153.33Mito_carr289-375 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_002245	`PF00153.33`	Mito_carr	67	148	2.4e-60	201.0
LXL04_002245	`PF00153.33`	Mito_carr	178	277	2.4e-60	201.0
LXL04_002245	`PF00153.33`	Mito_carr	289	375	2.4e-60	201.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LJX5`	拟南芥	Probable mitochondrial adenine nucleotide transporter BTL1	70.122%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9SUV1`	拟南芥	Adenine nucleotide transporter BT1, chloroplastic/mitochondrial	37.261%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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