基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000647
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 11904196-11905763
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1491 bp · LXL04_000647|LXL04_000647|OH1004|cDNA
ATGGCTTCTATTTACGGACTTGCGTCTTTCATGAATTGTATTTCTGTTAATAGAAACCCTAACCCTTTAATTTCCCAACTCCATGGAAATCTCACTGTCAATCCGTGCAATAGAGTATCAATTACAAACAGAAACCCTATCTTATCCGTTACTAGATTACGCCAATTTAGGTTTTATAAAGCCGTGGAGTTAGACACGTTTGTAACCAGCGACGACGAAGACGAAATGAGCGAAGGTTTCTTCGAGGCAATTGAGGAATT...
CDS
下载 CDS FASTA1491 bp · LXL04_000647|LXL04_000647|OH1004|CDS
ATGGCTTCTATTTACGGACTTGCGTCTTTCATGAATTGTATTTCTGTTAATAGAAACCCTAACCCTTTAATTTCCCAACTCCATGGAAATCTCACTGTCAATCCGTGCAATAGAGTATCAATTACAAACAGAAACCCTATCTTATCCGTTACTAGATTACGCCAATTTAGGTTTTATAAAGCCGTGGAGTTAGACACGTTTGTAACCAGCGACGACGAAGACGAAATGAGCGAAGGTTTCTTCGAGGCAATTGAGGAATT...
496 aa · LXL04_000647|LXL04_000647|OH1004|PROTEIN
MASIYGLASFMNCISVNRNPNPLISQLHGNLTVNPCNRVSITNRNPILSVTRLRQFRFYKAVELDTFVTSDDEDEMSEGFFEAIEELERMTREPSDVLEEMNSKLSARELQLVLVYFSQEGRDSWCALEVFEWLKKENKVDDETMELMVSLMCGWVKKLIQGKHETKDVIDLLVDMECVGLKPNFSMIEKVISLYWDMGEKDKGVLFVKEVLKRGFGYENGDNQGRKGGPTGYLAWKMMEDGNYTDAIKLVIEIKETNLK...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000647 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000647 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:11904196-11905763 (+) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to At2g30100: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006396 RNA processing 生物过程 GO:0006397 mRNA processing 生物过程 GO:0007005 mitochondrion organization 生物过程 GO:0008380 RNA splicing 生物过程 GO:0009658 chloroplast organization 生物过程 GO:0009880 embryonic pattern specification 生物过程 GO:0010019 chloroplast-nucleus signaling pathway 生物过程 GO:0031930 mitochondria-nucleus signaling pathway 生物过程 GO:0048366 leaf development 生物过程 GO:1900865 chloroplast RNA modification 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G10910 ath:AT2G30100 ath:AT2G31400 ath:AT5G04810 ath:AT5G61990 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
线粒体0.489
质体0.373
细胞核0.064
细胞质0.028
细胞膜0.011
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q0WNN7 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g30100, chloroplastic | 57.283% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q0WMY5 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g04810, chloroplastic | 22.691% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9FIT7 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g61990, mitochondrial | 22.619% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q0WVV0 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic | 22.326% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SIC9 | 拟南芥 | Pentatricopeptide repeat-containing protein GUN1, chloroplastic | 25.641% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |