基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000563
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 10369980-10372103
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA807 bp · LXL04_000563|LXL04_000563|OH1004|cDNA
ATGGCTTCAGTTATCGAAGCTGGATGGACGTACATGATCACTCATTTCAGTGACTTCCAGCTAGCTTGTGTTGGTAGCTTTATTCTACATGAAGCTGTCTTCTTTTTGTCTGGACTTCCTTTCGTATACATAGAAAAGGCAGGATGGctcaaaaaatacaaaattcaGGCCAAGAACAACACAAGTGAAGCTCAAGAGAAATGCATCACTCGCCTTCTTCTGTATCATTTCTGTGTGAACCTTCCTGTCATGCTTGCTTC...
CDS
下载 CDS FASTA807 bp · LXL04_000563|LXL04_000563|OH1004|CDS
ATGGCTTCAGTTATCGAAGCTGGATGGACGTACATGATCACTCATTTCAGTGACTTCCAGCTAGCTTGTGTTGGTAGCTTTATTCTACATGAAGCTGTCTTCTTTTTGTCTGGACTTCCTTTCGTATACATAGAAAAGGCAGGATGGCTCAAAAAATACAAAATTCAGGCCAAGAACAACACAAGTGAAGCTCAAGAGAAATGCATCACTCGCCTTCTTCTGTATCATTTCTGTGTGAACCTTCCTGTCATGCTTGCTTC...
268 aa · LXL04_000563|LXL04_000563|OH1004|PROTEIN
MASVIEAGWTYMITHFSDFQLACVGSFILHEAVFFLSGLPFVYIEKAGWLKKYKIQAKNNTSEAQEKCITRLLLYHFCVNLPVMLASYPVFRFMGMRSSLPLPSWKVMSTQILFYFIVEDFIFYWGHRILHTKWLYKHIHSVHHEYATPFGLTSEYAHPAEILFLGFATIFGPAITGPHLITLWLWMVVRVLETVEAHCGYHFPWSPSNFLPLYGGSDFHDYHHRLIYTKSGNYSSTFVYMDWIFGTDHGYRKLKALKSE...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000563 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000563 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:10369980-10372103 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to SMO2-2: Methylsterol monooxygenase 2-2 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0008610 lipid biosynthetic process 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0016126 sterol biosynthetic process 生物过程 GO:0080065 4-alpha-methyl-delta7-sterol oxidation 生物过程 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0000254 C-4 methylsterol oxidase activity 分子功能 GO:0005506 iron ion binding 分子功能 GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能 GO:0071771 aldehyde oxygenase (deformylating) activity 分子功能 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G07420 ath:AT2G29390 dosa:Os07g0101500 dosa:Os11g0707600 osa:4342171 osa:4351226 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.878
细胞质0.065
细胞核0.060
线粒体0.053
细胞膜0.049
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF04116.20FA_hydroxylase113-247 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_000563 | PF04116.20 | FA_hydroxylase | 113 | 247 | 1.3e-27 | 97.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8VWZ8 | 拟南芥 | Methylsterol monooxygenase 2-2 | 82.090% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9ZW22 | 拟南芥 | Methylsterol monooxygenase 2-1 | 80.370% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q69L93 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-8 | 71.923% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
B8B6I2 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-8 | 71.923% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q2QZ14 | 水稻 | Very-long-chain aldehyde decarbonylase GL1-11 | 72.692% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |