LXL04_000344 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_000344

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 6407275-6408315 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1041 bp · LXL04_000344|LXL04_000344|OH1004|cDNA

ATGCCTATAGCTTCTCATGCTTTCTCTCTTCCATCTGTACCTAAATGCAACCACGAAGGTAAAAAAGAAAGAGCAAATATGACCCTCACTTTTGATAGATACAAAGATAGGCTTCAAATGCTCTCCAAGGGGAAAGGTTGGATAACAGGAAACCTCTACATGTACCAAGGCTTTTGGCACCAATCCATGCGTAGAATCTCTATAGAAACTGTGATGGCTTTACAAGAAACTTTCAAAGCTCACCCAAAAGATATCTACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1041 bp · LXL04_000344|LXL04_000344|OH1004|CDS

ATGCCTATAGCTTCTCATGCTTTCTCTCTTCCATCTGTACCTAAATGCAACCACGAAGGTAAAAAAGAAAGAGCAAATATGACCCTCACTTTTGATAGATACAAAGATAGGCTTCAAATGCTCTCCAAGGGGAAAGGTTGGATAACAGGAAACCTCTACATGTACCAAGGCTTTTGGCACCAATCCATGCGTAGAATCTCTATAGAAACTGTGATGGCTTTACAAGAAACTTTCAAAGCTCACCCAAAAGATATCTACTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

346 aa · LXL04_000344|LXL04_000344|OH1004|PROTEIN

MPIASHAFSLPSVPKCNHEGKKERANMTLTFDRYKDRLQMLSKGKGWITGNLYMYQGFWHQSMRRISIETVMALQETFKAHPKDIYLVTLPKSGTTWLKALMFAIVNRNRYKNNSLSTHPLLISNPHDCLPFIETEIYRNTPTYVHENEPRLFATHIPYNSLPQSILESGCRLIYLCRNPKDVLVSMFHFANKLRDKSGGTMMAFEEAFESFSKGVMPLGPYWDHVKGYHEVSLEDPRKVLFVTYEDMKMDTVNHVKRLA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_000344`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_000344

位置 Chr01:6407275-6408315 (+)

描述 Similar to SOT15: Cytosolic sulfotransferase 15

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g07010`	磺基转移酶，利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐作为磺酸盐供体，特异性催化羟基茉莉酮酸酯的硫酸盐缀合，优先选择 12-羟基茉莉酮酸酯而不是 11-羟基茉莉酮酸酯。	Biochemical and molecular characterization of a hydroxyjasmonate sulfotransferase from Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m211943200
`At5g07000`	磺基转移酶利用 3'-磷酸-5'-腺苷基硫酸盐 (PAPS) 作为磺酸盐供体。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000344 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009694 jasmonic acid metabolic process 生物过程

GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程

GO:0051923 sulfation 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0008146 sulfotransferase activity 分子功能

GO:0047366 quercetin-3-sulfate 4'-sulfotransferase activity 分子功能

GO:0047894 flavonol 3-sulfotransferase activity 分子功能

GO:0080131 hydroxyjasmonate sulfotransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:AAA33342

ag:AAA33343

ath:AT5G07000

ath:AT5G07010

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.787

排名 1 · LXL04_000344 · OH-1004

细胞核0.211

排名 2 · LXL04_000344 · OH-1004

过氧化物酶体0.079

排名 3 · LXL04_000344 · OH-1004

内质网0.046

排名 4 · LXL04_000344 · OH-1004

线粒体0.044

排名 5 · LXL04_000344 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00685.34Sulfotransfer_182-339 aa

PF13469.13Sulfotransfer_3172-269 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_000344	`PF00685.34`	Sulfotransfer_1	82	339	3e-72	243.8
LXL04_000344	`PF13469.13`	Sulfotransfer_3	172	269	3.9e-08	34.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8L5A7`	拟南芥	Cytosolic sulfotransferase 15	41.076%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q8GZ53`	拟南芥	Cytosolic sulfotransferase 14	40.517%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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