基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkAUNG090180 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | ChrUn:25604021-25605336 (-) |
| 描述 | Similar to CASC125: (E)-beta-farnesene synthase (Artemisia annua OX%3D35608) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026028 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g45390 |
在需要 ATP 水解的过程中切割各种蛋白中的肽。 |
A nuclear-encoded ClpP subunit of the chloroplast ATP-dependent Clp protease is essential for early development in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1007/s00425-006-0292-2
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016102 | diterpenoid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.454; 覆盖度=64.556; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046246 | terpene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.344; 覆盖度=64.667; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051762 | sesquiterpene biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.124; 覆盖度=64.667; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.454; 覆盖度=64.556; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000287 | magnesium ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.454; 覆盖度=64.556; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010333 | terpene synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.454; 覆盖度=64.556; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034005 | germacrene-A synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.344; 覆盖度=64.667; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080016 | (-)-E-beta-caryophyllene synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.124; 覆盖度=64.667; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ag:AAL79181 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=54.124; 覆盖度=64.667; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ag:AMP42991 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.344; 覆盖度=64.667; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |