基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G231090 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:60198494-60201838 (+) |
| 描述 | Similar to FH18: Formin-like protein 18 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_029434 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g25050 |
类formin蛋白18。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g50000 |
酪蛋白激酶通过优先利用酸性蛋白如酪蛋白作为底物来操作定义(通过相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g67380 |
酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白(例如酪蛋白)作为底物来定义。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0280200 |
Formin 样蛋白 6。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0794900 |
类Formin蛋白7。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.392; 覆盖度=36.659; E 值=6.48e-52; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.178; 覆盖度=33.875; E 值=1.33e-53; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.392; 覆盖度=36.659; E 值=6.48e-52; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015630 | microtubule cytoskeleton | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.586; 覆盖度=33.643; E 值=8.86e-53; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090406 | pollen tube | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.586; 覆盖度=33.643; E 值=8.86e-53; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003779 | actin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.178; 覆盖度=33.875; E 值=1.33e-53; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004721 | phosphoprotein phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.178; 覆盖度=33.875; E 值=1.33e-53; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G25050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=69.178; 覆盖度=33.875; E 值=1.33e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G32400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.392; 覆盖度=36.659; E 值=6.48e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G58160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.586; 覆盖度=33.643; E 值=8.86e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0794900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=72.18; 覆盖度=30.858; E 值=1.03e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |