基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G203540 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:53208175-53210394 (-) |
| 描述 | Similar to PCO2: Plant cysteine oxidase 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_032765 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g39890 |
催化 N 端半胱氨酸残基(N-Cys)的氧化,从而为蛋白参与 N 端法则途径介导的蛋白酶体降解做准备,此过程在 N-端法则酶 ATE1、ATE2 和 PRT6 的作用之前。 | |
At5g15120 |
催化 N 端半胱氨酸残基(N-Cys)的氧化,从而为蛋白参与 N 端法则途径介导的蛋白酶体降解做准备,此过程在 N-端法则酶 ATE1、ATE2 和 PRT6 的作用之前。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g18490 |
催化N端半胱氨酸残基(N-Cys)的氧化,从而为N端规则途径介导的蛋白酶体降解做准备,位于N端规则酶ATE1、ATE2和PRT6(可能)的上游。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g42670 |
催化N端半胱氨酸残基(N-Cys)的氧化,从而为N端规则途径介导的蛋白酶体降解做准备,位于N端规则酶ATE1、ATE2和PRT6(可能)的上游。 |
The plant cysteine oxidases from Arabidopsis thaliana are kinetically tailored to act as oxygen sensors.2018 · DOI: 10.1074/jbc.ra118.003496
|
At3g58670 |
催化N端半胱氨酸残基(N-Cys)的氧化,从而为N端规则途径介导的蛋白酶体降解做准备,位于N端规则酶ATE1、ATE2和PRT6(可能)的上游。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0001666 | response to hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009061 | anaerobic respiration | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.629; 覆盖度=94.361; E 值=1.57e-61; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0018171 | peptidyl-cysteine oxidation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070483 | detection of hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071456 | cellular response to hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.813; 覆盖度=104.511; E 值=1.37e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.021; 覆盖度=88.346; E 值=5.55e-44; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017172 | cysteine dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G18490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.813; 覆盖度=104.511; E 值=1.37e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G42670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.021; 覆盖度=88.346; E 值=5.55e-44 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G58670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=36.709; 覆盖度=89.098; E 值=2.5e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G15120 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.629; 覆盖度=94.361; E 值=1.57e-61 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G39890 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.781; 覆盖度=87.594; E 值=1.89e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |