基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA08G093200 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr08:24134188-24137638 (+) |
| 描述 | Similar to TGA1: Transcription factor TGA1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_031192 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g65210 |
特异性结合 DNA 序列 5'-TGACG-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g10030 |
特异性结合 DNA 序列 5'-TGACG-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g77920 |
特异性结合 DNA 序列 5'-TGACG-3' 的转录激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g22070 |
转录激活因子,能够特异性结合DNA序列5'-TGACG-3'。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0637000 |
参与防御反应的转录调控因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009626 | plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.243; 覆盖度=101.648; E 值=2.43e-121; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009862 | systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.243; 覆盖度=101.648; E 值=2.43e-121; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005516 | calmodulin binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.243; 覆盖度=101.648; E 值=2.43e-121; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G22070 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.243; 覆盖度=101.648; E 值=2.43e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G77920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.474; 覆盖度=104.396; E 值=3.03e-131 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G10030 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=56.319; 覆盖度=100.0; E 值=3.56e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G65210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=101.099; E 值=1.67e-136 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |