基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G410780 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:103735509-103736595 (-) |
| 描述 | Similar to TIFY11C: Protein TIFY 11c (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_008139 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XD79 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0180900 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0402800 |
茉莉酸响应抑制因子(通过相似性预测)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.448; 覆盖度=31.351; E 值=2.94e-09; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.448; 覆盖度=31.351; E 值=2.94e-09; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009753 | response to jasmonic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.028; 覆盖度=38.378; E 值=6.24e-09; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031347 | regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.448; 覆盖度=31.351; E 值=2.94e-09; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000022 | regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.448; 覆盖度=31.351; E 值=2.94e-09; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.448; 覆盖度=31.351; E 值=2.94e-09; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os03g0180900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.448; 覆盖度=31.351; E 值=2.94e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0402800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.028; 覆盖度=38.378; E 值=6.24e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0615200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.625; 覆盖度=34.595; E 值=1.18e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |