基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G398720 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:100175614-100177049 (-) |
| 描述 | Similar to CYCD5-1: Cyclin-D5-1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030340 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g37630 |
细胞周期蛋白D5-1。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g70210 |
可能激活根分生组织 (RAM) 的细胞周期,并促进胚根(胚轴根)伸出。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0203800 |
细胞周期蛋白D5-3。 | 暂无已核实直接文献 |
Os12g0588800 |
细胞周期蛋白D5-2。 | 暂无已核实直接文献 |
Os08g0421100 |
细胞周期蛋白D1-2。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000082 | G1/S transition of mitotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042023 | DNA endoreduplication | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000307 | cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016538 | cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G70210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.714; 覆盖度=57.377; E 值=1.28e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G37630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.224; 覆盖度=99.672; E 值=3.64e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0203800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.167; 覆盖度=78.689; E 值=1.27e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0617500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=40.566; 覆盖度=69.508; E 值=9.39e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:9271619 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.331; 覆盖度=59.344; E 值=3.34e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |