基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA07G383880 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr07:96295097-96298074 (-) |
| 描述 | Similar to CYCD4-1: Cyclin-D4-1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030172 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g22490 |
在细胞周期 G1 期起作用,以控制茎尖和根尖分生组织的细胞分裂速率。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g65420 |
可能激活根分生组织 (RAM) 的细胞周期,并促进胚根(胚轴根)伸出。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0466100 |
细胞周期蛋白D4-1。 | 暂无已核实直接文献 |
Os08g0479300 |
细胞周期蛋白D4-2。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0620800 |
细胞周期蛋白D2-2。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000082 | G1/S transition of mitotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009744 | response to sucrose | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.507; 覆盖度=78.363; E 值=1.76e-77; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010440 | stomatal lineage progression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.507; 覆盖度=78.363; E 值=1.76e-77; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000307 | cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016538 | cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G22490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.478; 覆盖度=100.877; E 值=2.49e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G65420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.507; 覆盖度=78.363; E 值=1.76e-77 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0217900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=42.373; 覆盖度=103.509; E 值=2.5e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0620800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.854; 覆盖度=88.012; E 值=1.41e-74 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0466100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.658; 覆盖度=87.135; E 值=4.49e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |