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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA06G456840
当前查询版本TK1151
位置Chr06:112907577-112910047 (-)
描述Similar to CRR4: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g45350%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022737 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g45350 在叶绿体 RNA 编辑中发挥重要作用。
At3g49142 推定含五重复肽的蛋白质 At3g49142。 暂无已核实直接文献
At4g21300 含五肽重复的蛋白 At4g21300。 暂无已核实直接文献
At3g14730 含五重复肽重复的蛋白At3g14730。 暂无已核实直接文献
At2g03880 含五聚肽重复的蛋白At2g03880,线粒体定位。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.895; 覆盖度=102.703; E 值=2.27e-34; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016556mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0099402plant organ development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.895; 覆盖度=102.703; E 值=2.27e-34; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.895; 覆盖度=102.703; E 值=2.27e-34; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005773vacuole细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G35030KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=37.895; 覆盖度=102.703; E 值=2.27e-34UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G45350KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.522; 覆盖度=74.595; E 值=3.31e-50UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release