基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G395960 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:98118752-98124656 (-) |
| 描述 | Similar to ADCS: Aminodeoxychorismate synthase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_023126 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g28880 |
双功能酶,催化从分支酸和谷氨酰胺生物合成 4-氨基-4-脱氧分支酸。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os06g0699700 |
双功能酶,催化从莽草酸和谷氨酰胺生成4-氨基-4-脱氧莽草酸(ADC)。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000162 | L-tryptophan biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.327; 覆盖度=90.323; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008153 | 4-aminobenzoate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009396 | folic acid-containing compound biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.327; 覆盖度=90.323; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0017000 | antibiotic biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.327; 覆盖度=90.323; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046417 | chorismate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046654 | tetrahydrofolate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046656 | folic acid biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=NAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046820 | 4-amino-4-deoxychorismate synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28880 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=59.328; 覆盖度=106.221; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0699700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=59.042; 覆盖度=96.198; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:543912 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.903; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sve:SVEN_0920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.723; 覆盖度=91.359; E 值=1.22e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |