基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G177290 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:46452552-46454890 (-) |
| 描述 | Similar to CG7427: DCN1-like protein (Drosophila melanogaster OX%3D7227) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024103 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g28970 |
可能通过将 NEDD8 从 N 端乙酰化的 NEDD8 连接 E2 酶转移到不同的 cullin C 端结构域-RBX 复合物,从而促进所有 cullin 的 neddylation;cullin 的 neddylation 在 SCF 型复合物活性调控中起关键作用(通过相似性推测)。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035212 | cell competition in a multicellular organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.017; 覆盖度=41.319; E 值=6.77e-26; UniProt GO evidence=IMP:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045116 | protein neddylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000434 | regulation of protein neddylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.708; 覆盖度=39.236; E 值=7.46e-26; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000436 | positive regulation of protein neddylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.017; 覆盖度=41.319; E 值=6.77e-26; UniProt GO evidence=IMP:FlyBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000151 | ubiquitin ligase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.017; 覆盖度=41.319; E 值=6.77e-26; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031624 | ubiquitin conjugating enzyme binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032182 | ubiquitin-like protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0097602 | cullin family protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G28970 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.689; 覆盖度=102.778; E 值=1.27e-93 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dme:Dmel_CG7427 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=42.017; 覆盖度=41.319; E 值=6.77e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gga:424963 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.616; 覆盖度=50.694; E 值=1.52e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:55208 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.708; 覆盖度=39.236; E 值=7.46e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:102323 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.071; 覆盖度=38.889; E 值=1.71e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |