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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDTkA06G117330
当前查询版本TK1151
位置Chr06:30718420-30719391 (-)
描述Similar to MYB4: Transcription factor MYB4 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_024690 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g23250 转录因子,参与CBF基因的低温调控以及抗冻能力的发育。
At1g79180 转录激活因子,结合 DNA 上的 AC 顺式元件 5'-ACCTACC-3'、5'-ACCAACC-3' 和 5'-ACCTAAC-3' 的启动子,并在 SND1 介导的次级细胞壁形成过程中特异性激活木质素生物合成基因。
At3g12820 参与金属离子稳态,包括通过调节NAS4和NAS2基因表达获得铁离子(Fe)。 暂无已核实直接文献

水稻

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.655; 覆盖度=52.727; E 值=1.39e-49; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009409response to cold生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.655; 覆盖度=52.727; E 值=1.39e-49; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009414response to water deprivation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.712; 覆盖度=53.636; E 值=1.75e-49; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009651response to salt stress生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.712; 覆盖度=53.636; E 值=1.75e-49; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009909regulation of flower development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.486; 覆盖度=81.364; E 值=2.58e-47; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045893positive regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.655; 覆盖度=52.727; E 值=1.39e-49; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0050826response to freezing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=62.931; 覆盖度=52.727; E 值=4.66e-47; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.655; 覆盖度=52.727; E 值=1.39e-49; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000976transcription cis-regulatory region binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.486; 覆盖度=81.364; E 值=2.58e-47; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.655; 覆盖度=52.727; E 值=1.39e-49; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.712; 覆盖度=53.636; E 值=1.75e-49; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G06180KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.486; 覆盖度=81.364; E 值=2.58e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G31180KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=62.931; 覆盖度=52.727; E 值=4.66e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G23250KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.712; 覆盖度=53.636; E 值=1.75e-49UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os02g0624300KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.538; 覆盖度=53.182; E 值=2.79e-48UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os04g0517100KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.655; 覆盖度=52.727; E 值=1.39e-49UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGosa:4330027KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.538; 覆盖度=53.182; E 值=2.79e-48UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release