基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA06G044480 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr06:12020143-12023749 (-) |
| 描述 | Similar to TIFY9: Protein TIFY 9 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025722 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g13220 |
茉莉酸(JA)反应的抑制因子,缺失整个 Jas 域,并表现为对 JA 的严重不敏感以及对 JA 诱导降解的抗性。 |
A downstream mediator in the growth repression limb of the jasmonate pathway.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050708
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2XSX6 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0395800 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XD79 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0180900 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009753 | response to jasmonic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010112 | regulation of systemic acquired resistance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031347 | regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000022 | regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.135; 覆盖度=60.326; E 值=8.64e-09; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G74950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=35.135; 覆盖度=60.326; E 值=8.64e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G43440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=32.967; 覆盖度=49.457; E 值=1.75e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G13220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=38.579; 覆盖度=107.065; E 值=1.09e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0395800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=39.56; 覆盖度=49.457; E 值=2.77e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |